More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1115 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  100 
 
 
718 aa  1493    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.65 
 
 
727 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.34 
 
 
732 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.65 
 
 
734 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.17 
 
 
736 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.5 
 
 
739 aa  271  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.5 
 
 
739 aa  271  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  29.2 
 
 
736 aa  266  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  28.42 
 
 
756 aa  258  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.32 
 
 
732 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.23 
 
 
730 aa  254  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.59 
 
 
732 aa  254  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.92 
 
 
735 aa  251  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.71 
 
 
725 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.91 
 
 
725 aa  244  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.04 
 
 
725 aa  243  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.23 
 
 
740 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.51 
 
 
726 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.89 
 
 
728 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  26.72 
 
 
782 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  26.52 
 
 
779 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  26.52 
 
 
779 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  27.3 
 
 
653 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  27.3 
 
 
653 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  22.92 
 
 
783 aa  135  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  25.73 
 
 
800 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.84 
 
 
735 aa  114  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  20.75 
 
 
840 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.41 
 
 
730 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  22.43 
 
 
850 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  22 
 
 
850 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.39 
 
 
850 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.67 
 
 
851 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.53 
 
 
844 aa  91.7  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  20.95 
 
 
843 aa  90.9  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.93 
 
 
842 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.05 
 
 
850 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  20.83 
 
 
849 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  28.57 
 
 
1083 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  21.32 
 
 
844 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.43 
 
 
840 aa  75.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  28.82 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2884  hypothetical protein  23.14 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179346  hitchhiker  0.000404668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  32.74 
 
 
1075 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.11 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  30.95 
 
 
1074 aa  71.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.29 
 
 
534 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.18 
 
 
461 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37787  predicted protein  28.99 
 
 
1059 aa  68.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44507  predicted protein  28.97 
 
 
563 aa  69.3  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.45 
 
 
629 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.45 
 
 
626 aa  67  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.77 
 
 
600 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  20.97 
 
 
849 aa  67.4  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1899  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.03 
 
 
144 aa  65.5  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  31.68 
 
 
1072 aa  65.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
1370 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  26.83 
 
 
969 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0752  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.42 
 
 
612 aa  61.6  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0839  NADPH-sulfite reductase flavoprotein subunit  26.42 
 
 
612 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.305761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  32.43 
 
 
1405 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.54 
 
 
613 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  29.09 
 
 
1232 aa  59.7  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3085  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.23 
 
 
455 aa  59.3  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1600  PepSY-associated TM helix  23.56 
 
 
464 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239487  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1570  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.04 
 
 
464 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105469  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1624  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.56 
 
 
464 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.37 
 
 
612 aa  58.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  19.96 
 
 
822 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  24.21 
 
 
466 aa  58.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  26 
 
 
381 aa  58.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  27.78 
 
 
1053 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  27.01 
 
 
561 aa  58.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  28.3 
 
 
411 aa  57.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  27.59 
 
 
623 aa  57.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  28.02 
 
 
1403 aa  57.4  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.46 
 
 
435 aa  57.4  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  40.3 
 
 
513 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15777  predicted protein  29.57 
 
 
299 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.112856  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  31.78 
 
 
1317 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  27.54 
 
 
1401 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  24.14 
 
 
371 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.63 
 
 
614 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.45 
 
 
613 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  27.92 
 
 
628 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 
1396 aa  56.6  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  29.63 
 
 
1065 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2687  PepSY-associated TM helix  25.36 
 
 
464 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1893  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.92 
 
 
365 aa  55.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55602  NADPH-ferrihemoprotein reductase  25.26 
 
 
603 aa  55.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
1400 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0992  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.69 
 
 
245 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0107588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.63 
 
 
1065 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2584  FAD-binding domain protein  29.49 
 
 
521 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  0.0303893 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00595  NADPH--cytochrome P450 reductase (Eurofung)  31.11 
 
 
695 aa  55.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.55 
 
 
885 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  28.5 
 
 
1065 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50814  predicted protein  26.44 
 
 
401 aa  55.1  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0259055 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  26.02 
 
 
607 aa  55.1  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  26.2 
 
 
599 aa  55.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>