More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4965 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  52.04 
 
 
726 aa  670    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
730 aa  1421    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  62.43 
 
 
728 aa  836    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  61.34 
 
 
725 aa  774    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  50.41 
 
 
732 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  73.02 
 
 
732 aa  978    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.57 
 
 
739 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.57 
 
 
739 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  48.1 
 
 
734 aa  627  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  49.93 
 
 
756 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.91 
 
 
736 aa  615  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  49.66 
 
 
736 aa  617  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  49.23 
 
 
779 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  49.23 
 
 
779 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.94 
 
 
740 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  48.28 
 
 
782 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.76 
 
 
735 aa  589  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  46.15 
 
 
725 aa  532  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  48.85 
 
 
653 aa  532  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  46.49 
 
 
725 aa  531  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  48.85 
 
 
653 aa  532  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.79 
 
 
727 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.36 
 
 
718 aa  270  5.9999999999999995e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.42 
 
 
732 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  31.36 
 
 
783 aa  206  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  37.39 
 
 
800 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.92 
 
 
849 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.75 
 
 
850 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  30.39 
 
 
850 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.51 
 
 
850 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.02 
 
 
851 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  28.94 
 
 
844 aa  161  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.37 
 
 
842 aa  161  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.53 
 
 
843 aa  160  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  35.95 
 
 
466 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.82 
 
 
461 aa  150  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.24 
 
 
840 aa  148  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  28.21 
 
 
850 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.23 
 
 
844 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.52 
 
 
526 aa  137  9e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.29 
 
 
730 aa  134  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  31.95 
 
 
513 aa  134  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.26 
 
 
534 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.34 
 
 
735 aa  122  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.48 
 
 
533 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  37.38 
 
 
1342 aa  111  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.24 
 
 
1384 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  36.74 
 
 
1232 aa  109  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  32.17 
 
 
599 aa  107  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  33.8 
 
 
613 aa  107  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  36.09 
 
 
1418 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  37.79 
 
 
659 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  36.09 
 
 
1418 aa  107  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  36.09 
 
 
1418 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  36.09 
 
 
1398 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.6 
 
 
594 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  35.19 
 
 
526 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  36.09 
 
 
1418 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  36.09 
 
 
1418 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  36.09 
 
 
1418 aa  106  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  35.19 
 
 
614 aa  105  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  34.2 
 
 
1400 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.11 
 
 
594 aa  104  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  37.04 
 
 
883 aa  104  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  35.65 
 
 
1427 aa  104  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.11 
 
 
591 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.26 
 
 
626 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  35.48 
 
 
1405 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  34.19 
 
 
376 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.26 
 
 
629 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  31.25 
 
 
599 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  33.95 
 
 
602 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 
1313 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.87 
 
 
600 aa  102  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  31.94 
 
 
600 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  31.25 
 
 
599 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  31.25 
 
 
599 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.47 
 
 
604 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  31.25 
 
 
599 aa  101  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  31.94 
 
 
612 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  44 
 
 
511 aa  101  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  32.75 
 
 
609 aa  101  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  31.25 
 
 
599 aa  101  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.47 
 
 
509 aa  101  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.47 
 
 
604 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.03 
 
 
604 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  31.25 
 
 
599 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  31.25 
 
 
599 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  31.5 
 
 
599 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.78 
 
 
588 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  37.78 
 
 
588 aa  100  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  31.56 
 
 
600 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.88 
 
 
599 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.7 
 
 
614 aa  100  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  30.88 
 
 
599 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  30.51 
 
 
601 aa  99.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.49 
 
 
1383 aa  100  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.1 
 
 
599 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.35 
 
 
600 aa  100  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  30.88 
 
 
599 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>