More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.65 
 
 
849 aa  744    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  100 
 
 
783 aa  1546    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  44.94 
 
 
844 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  47.15 
 
 
840 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.06 
 
 
850 aa  775    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.89 
 
 
842 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  50.41 
 
 
850 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.7 
 
 
850 aa  770    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  51 
 
 
850 aa  738    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.24 
 
 
843 aa  653    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  44.59 
 
 
822 aa  592  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.21 
 
 
851 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.17 
 
 
849 aa  572  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.23 
 
 
840 aa  555  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.32 
 
 
892 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.43 
 
 
885 aa  492  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.62 
 
 
844 aa  410  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  50.85 
 
 
466 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.47 
 
 
521 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  45.42 
 
 
513 aa  338  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.79 
 
 
461 aa  337  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  45.57 
 
 
511 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.12 
 
 
526 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  42.09 
 
 
533 aa  321  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.64 
 
 
534 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  42.97 
 
 
380 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  42.97 
 
 
380 aa  273  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  45.58 
 
 
381 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  37.53 
 
 
381 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  39.7 
 
 
398 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  38.54 
 
 
397 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.41 
 
 
732 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.51 
 
 
403 aa  219  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.45 
 
 
734 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  39.02 
 
 
388 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  31.47 
 
 
756 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.87 
 
 
739 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.87 
 
 
739 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.29 
 
 
730 aa  204  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.61 
 
 
726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.93 
 
 
735 aa  202  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  37.8 
 
 
411 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32.28 
 
 
725 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.7 
 
 
730 aa  198  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.99 
 
 
725 aa  196  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  39.89 
 
 
398 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.9 
 
 
725 aa  190  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  29.67 
 
 
736 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.69 
 
 
736 aa  181  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.28 
 
 
735 aa  178  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.17 
 
 
732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.41 
 
 
740 aa  173  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.24 
 
 
727 aa  172  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.34 
 
 
728 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  37.53 
 
 
381 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.08 
 
 
369 aa  164  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  31.86 
 
 
371 aa  154  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  27.75 
 
 
410 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.09 
 
 
323 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.68 
 
 
718 aa  147  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  39.83 
 
 
1384 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.78 
 
 
732 aa  137  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  40.65 
 
 
1400 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.53 
 
 
600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  24.6 
 
 
459 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  36.7 
 
 
614 aa  132  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  27.01 
 
 
385 aa  131  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  39.72 
 
 
1403 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.25 
 
 
1401 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.19 
 
 
613 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  36.86 
 
 
539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  36.82 
 
 
539 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.59 
 
 
600 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  39.9 
 
 
1257 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  26.53 
 
 
388 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  25.87 
 
 
381 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  39.25 
 
 
1405 aa  127  7e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.97 
 
 
588 aa  127  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  38.97 
 
 
588 aa  127  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.59 
 
 
409 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.64 
 
 
613 aa  127  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  39.11 
 
 
1338 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  25.26 
 
 
372 aa  126  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  40 
 
 
1405 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  39.27 
 
 
1418 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  39.27 
 
 
1418 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  39.27 
 
 
1398 aa  126  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  35.56 
 
 
628 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  39.27 
 
 
1418 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.79 
 
 
1395 aa  126  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  39.27 
 
 
1427 aa  126  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  39.27 
 
 
1418 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.88 
 
 
607 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  39.27 
 
 
1418 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  39.27 
 
 
1418 aa  126  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.35 
 
 
385 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  38.79 
 
 
1397 aa  125  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  38.79 
 
 
1397 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  35.81 
 
 
612 aa  123  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.16 
 
 
599 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>