More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2738 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  45.86 
 
 
734 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
726 aa  1468    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  48.17 
 
 
736 aa  658    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  47.88 
 
 
779 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  50.93 
 
 
756 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50 
 
 
736 aa  697    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  47.7 
 
 
782 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  47.88 
 
 
779 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  48.57 
 
 
732 aa  673    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  52.04 
 
 
730 aa  682    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  48.37 
 
 
735 aa  645    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  51.84 
 
 
732 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.41 
 
 
740 aa  763    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.96 
 
 
739 aa  791    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.96 
 
 
739 aa  791    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.7 
 
 
728 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.4 
 
 
725 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  48.54 
 
 
653 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  48.54 
 
 
653 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.32 
 
 
725 aa  559  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.04 
 
 
725 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.63 
 
 
727 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.16 
 
 
732 aa  296  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.37 
 
 
718 aa  257  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  34.51 
 
 
800 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  30.19 
 
 
783 aa  206  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.02 
 
 
842 aa  183  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  28.97 
 
 
850 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.79 
 
 
850 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  28.96 
 
 
850 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.95 
 
 
850 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.57 
 
 
851 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.55 
 
 
849 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.22 
 
 
461 aa  154  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  27.37 
 
 
822 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.15 
 
 
844 aa  147  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.24 
 
 
843 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  31.46 
 
 
466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.17 
 
 
730 aa  129  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.08 
 
 
534 aa  124  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.49 
 
 
892 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.62 
 
 
735 aa  114  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  35.11 
 
 
594 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.89 
 
 
594 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.96 
 
 
1418 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.96 
 
 
1418 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  36.62 
 
 
588 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  35.96 
 
 
1398 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  35.96 
 
 
1418 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  35.96 
 
 
1418 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.96 
 
 
1418 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.62 
 
 
588 aa  109  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35.96 
 
 
1418 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  35.98 
 
 
1342 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  35.51 
 
 
1427 aa  108  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  34.06 
 
 
613 aa  107  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  29.16 
 
 
844 aa  107  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  33.33 
 
 
607 aa  107  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  34.51 
 
 
599 aa  107  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  34.51 
 
 
599 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.19 
 
 
610 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  34.51 
 
 
599 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.33 
 
 
604 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  33.64 
 
 
612 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.89 
 
 
599 aa  106  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  34.07 
 
 
599 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  34.07 
 
 
599 aa  106  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.33 
 
 
604 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.9 
 
 
604 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  34.07 
 
 
599 aa  105  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  34.07 
 
 
599 aa  105  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.52 
 
 
1384 aa  105  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  34.07 
 
 
599 aa  104  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  34.07 
 
 
599 aa  104  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.91 
 
 
607 aa  104  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  34.21 
 
 
599 aa  104  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.95 
 
 
607 aa  104  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.19 
 
 
596 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  33.63 
 
 
599 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  34.48 
 
 
1403 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.38 
 
 
840 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  34.63 
 
 
599 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  34.06 
 
 
631 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  34.35 
 
 
600 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  34.42 
 
 
614 aa  102  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.02 
 
 
840 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  34.35 
 
 
600 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  34.35 
 
 
612 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  34.93 
 
 
1313 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  33.02 
 
 
623 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.58 
 
 
1401 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  34.63 
 
 
609 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  33.33 
 
 
599 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.89 
 
 
591 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  33.77 
 
 
599 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  33.77 
 
 
599 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.02 
 
 
599 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.02 
 
 
599 aa  101  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  35.06 
 
 
609 aa  101  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.02 
 
 
599 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>