More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0272 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.46 
 
 
736 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  50.41 
 
 
726 aa  715    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
740 aa  1526    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.81 
 
 
739 aa  774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.81 
 
 
739 aa  774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.72 
 
 
732 aa  619  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  43.4 
 
 
736 aa  615  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  41.41 
 
 
779 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  41.41 
 
 
779 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  41.25 
 
 
782 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  42.72 
 
 
756 aa  597  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  41.72 
 
 
734 aa  593  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.47 
 
 
735 aa  591  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.94 
 
 
730 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.8 
 
 
728 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.43 
 
 
732 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.34 
 
 
725 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  41.56 
 
 
653 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  41.56 
 
 
653 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.19 
 
 
725 aa  496  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.05 
 
 
725 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.16 
 
 
727 aa  283  9e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.53 
 
 
732 aa  251  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.23 
 
 
718 aa  234  3e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  31.94 
 
 
800 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.77 
 
 
842 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.03 
 
 
850 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.15 
 
 
850 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.29 
 
 
849 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  25.43 
 
 
783 aa  157  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.62 
 
 
851 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.29 
 
 
850 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.82 
 
 
843 aa  145  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  24.32 
 
 
850 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  24.76 
 
 
840 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.49 
 
 
840 aa  140  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.55 
 
 
844 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  29.05 
 
 
513 aa  120  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.29 
 
 
730 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  24 
 
 
735 aa  106  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  30.31 
 
 
1342 aa  105  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  32.13 
 
 
623 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.36 
 
 
534 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  32.13 
 
 
631 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.41 
 
 
461 aa  102  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  32.82 
 
 
561 aa  100  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.64 
 
 
588 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  34.64 
 
 
588 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50814  predicted protein  32.82 
 
 
401 aa  99.4  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0259055 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.37 
 
 
614 aa  97.8  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.02 
 
 
600 aa  97.4  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.65 
 
 
844 aa  95.9  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  25.93 
 
 
511 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  33.96 
 
 
615 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.42 
 
 
612 aa  95.5  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  25.82 
 
 
466 aa  94.7  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0752  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.08 
 
 
612 aa  94  9e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  33.33 
 
 
1063 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  30.6 
 
 
613 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  24.95 
 
 
533 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  30.52 
 
 
602 aa  92.8  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  31.17 
 
 
1418 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  33.64 
 
 
883 aa  92.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.91 
 
 
610 aa  92  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.61 
 
 
892 aa  92  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.17 
 
 
1418 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  31.17 
 
 
1418 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.17 
 
 
1418 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.17 
 
 
1418 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  31.17 
 
 
1398 aa  91.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.17 
 
 
1418 aa  91.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0839  NADPH-sulfite reductase flavoprotein subunit  31.6 
 
 
612 aa  91.7  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.305761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.67 
 
 
526 aa  91.3  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  31.98 
 
 
1071 aa  91.3  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44507  predicted protein  30.53 
 
 
563 aa  90.9  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  30.74 
 
 
1427 aa  90.1  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 
1313 aa  90.5  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.69 
 
 
599 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  33.49 
 
 
659 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0719  oxidoreductase, FAD-binding  35.53 
 
 
350 aa  89.4  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  31.67 
 
 
628 aa  89.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.67 
 
 
607 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  29.58 
 
 
675 aa  89.7  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.44 
 
 
582 aa  89.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.31 
 
 
614 aa  89  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.09 
 
 
599 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  29.44 
 
 
600 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  27.72 
 
 
1383 aa  88.6  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  27.09 
 
 
599 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  32.26 
 
 
595 aa  88.6  4e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  29.44 
 
 
612 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  27.09 
 
 
599 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  29.44 
 
 
600 aa  88.6  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.84 
 
 
595 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  36.88 
 
 
1074 aa  87.8  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 
1384 aa  87.8  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.32 
 
 
629 aa  87.8  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.32 
 
 
626 aa  87.8  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  33.48 
 
 
1065 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30 
 
 
1401 aa  87.4  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>