More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0903 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  93.29 
 
 
850 aa  1613    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  93.53 
 
 
849 aa  1617    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  62.67 
 
 
822 aa  1025    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.65 
 
 
843 aa  1072    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  64.04 
 
 
840 aa  1093    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  66 
 
 
842 aa  1149    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  47.13 
 
 
844 aa  714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  66.28 
 
 
850 aa  1070    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
850 aa  1716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  65.93 
 
 
850 aa  1074    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.49 
 
 
840 aa  654    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  90.24 
 
 
851 aa  1572    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.56 
 
 
885 aa  626  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.11 
 
 
849 aa  615  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.17 
 
 
892 aa  600  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  54.31 
 
 
783 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.12 
 
 
844 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  51.36 
 
 
533 aa  445  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.21 
 
 
521 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  49.57 
 
 
511 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.55 
 
 
526 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  50.22 
 
 
513 aa  409  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.04 
 
 
534 aa  362  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.9 
 
 
461 aa  351  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  37.6 
 
 
380 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  37.6 
 
 
380 aa  248  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  39.41 
 
 
381 aa  241  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  34.61 
 
 
397 aa  220  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  59.09 
 
 
466 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  33.16 
 
 
381 aa  212  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  37.06 
 
 
388 aa  211  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  35.25 
 
 
1257 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.24 
 
 
398 aa  206  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  36.36 
 
 
398 aa  205  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  29.01 
 
 
969 aa  204  8e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
1357 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  32.34 
 
 
1397 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  32.62 
 
 
1313 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.15 
 
 
1418 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  33.15 
 
 
1418 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  33.15 
 
 
1398 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  33.15 
 
 
1418 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.15 
 
 
1418 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.15 
 
 
1418 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.15 
 
 
1418 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.34 
 
 
1395 aa  196  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  33.4 
 
 
1427 aa  196  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.56 
 
 
614 aa  195  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  31.96 
 
 
1397 aa  195  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  30.32 
 
 
1312 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 
1405 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.02 
 
 
582 aa  195  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  34.1 
 
 
1338 aa  194  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.32 
 
 
403 aa  191  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.21 
 
 
1401 aa  191  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 
1395 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  32.76 
 
 
1341 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 
1395 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 
1395 aa  189  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  31.34 
 
 
1400 aa  188  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.64 
 
 
594 aa  188  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  29.31 
 
 
602 aa  187  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  31.09 
 
 
1403 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  26.9 
 
 
614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.98 
 
 
734 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  30.98 
 
 
608 aa  186  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  30.78 
 
 
1370 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  35.28 
 
 
411 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  30.09 
 
 
588 aa  185  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.09 
 
 
588 aa  185  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.8 
 
 
600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.94 
 
 
599 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.98 
 
 
739 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.98 
 
 
739 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.27 
 
 
509 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.66 
 
 
1271 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  30.74 
 
 
1384 aa  183  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.37 
 
 
613 aa  183  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.7 
 
 
1271 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.7 
 
 
1271 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 
1409 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  32.19 
 
 
1342 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.91 
 
 
599 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  29.16 
 
 
623 aa  181  5.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.73 
 
 
599 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.58 
 
 
584 aa  180  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.55 
 
 
599 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.72 
 
 
594 aa  179  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.07 
 
 
607 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.96 
 
 
591 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.07 
 
 
613 aa  178  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.55 
 
 
599 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.97 
 
 
598 aa  178  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.73 
 
 
600 aa  178  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.02 
 
 
589 aa  177  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  28.41 
 
 
631 aa  177  9e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  29.04 
 
 
1407 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32 
 
 
1232 aa  176  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.22 
 
 
596 aa  174  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.84 
 
 
629 aa  173  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>