More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5053 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
461 aa  920    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  56.01 
 
 
466 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.11 
 
 
526 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.36 
 
 
521 aa  361  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.21 
 
 
850 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.92 
 
 
850 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  46.11 
 
 
533 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  40.62 
 
 
844 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.06 
 
 
534 aa  344  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.33 
 
 
843 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  42.3 
 
 
840 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  42.98 
 
 
822 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.08 
 
 
842 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.59 
 
 
851 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  42.91 
 
 
513 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.25 
 
 
849 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  47.79 
 
 
783 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  44.83 
 
 
850 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  44.21 
 
 
850 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.31 
 
 
840 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.2 
 
 
885 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.31 
 
 
849 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.22 
 
 
892 aa  293  4e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  59.91 
 
 
511 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.77 
 
 
844 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.88 
 
 
735 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.53 
 
 
726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.89 
 
 
730 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.77 
 
 
730 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  29.5 
 
 
736 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.72 
 
 
739 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.72 
 
 
739 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.43 
 
 
323 aa  146  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.38 
 
 
725 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.64 
 
 
734 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.63 
 
 
725 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.11 
 
 
732 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  31.4 
 
 
756 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.14 
 
 
582 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 
1257 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.46 
 
 
600 aa  133  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  41.55 
 
 
1397 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  41.55 
 
 
1397 aa  133  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  40.64 
 
 
1342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.55 
 
 
1395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.26 
 
 
732 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  43.06 
 
 
1338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  35.45 
 
 
614 aa  130  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  40.83 
 
 
1357 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  40.27 
 
 
600 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.91 
 
 
594 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.09 
 
 
605 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.82 
 
 
594 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  41.1 
 
 
1405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.71 
 
 
735 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  40.37 
 
 
1341 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.91 
 
 
591 aa  128  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  39.45 
 
 
614 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  39.37 
 
 
599 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  39.82 
 
 
612 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  39.82 
 
 
600 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.12 
 
 
584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.56 
 
 
599 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  40.09 
 
 
599 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.61 
 
 
610 aa  126  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  38.91 
 
 
599 aa  126  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  37.16 
 
 
623 aa  126  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.91 
 
 
599 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  39.64 
 
 
599 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  38.91 
 
 
599 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  38.91 
 
 
599 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.01 
 
 
604 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.01 
 
 
599 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  38.91 
 
 
599 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  38.91 
 
 
599 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  40.45 
 
 
1403 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.01 
 
 
607 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  37.16 
 
 
631 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  38.91 
 
 
599 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  31.92 
 
 
736 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.53 
 
 
613 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  38.46 
 
 
599 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.1 
 
 
599 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  40.27 
 
 
659 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.55 
 
 
1401 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  39.19 
 
 
599 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  38.91 
 
 
599 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.96 
 
 
613 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.1 
 
 
599 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.56 
 
 
604 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.1 
 
 
596 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.1 
 
 
599 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.56 
 
 
604 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  38.01 
 
 
1384 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.01 
 
 
607 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  39.19 
 
 
599 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  39.21 
 
 
1313 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  39.27 
 
 
1400 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  38.86 
 
 
969 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  36.97 
 
 
1312 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>