More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5636 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  69.57 
 
 
511 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  100 
 
 
533 aa  1061    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  58.55 
 
 
521 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.72 
 
 
526 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.02 
 
 
850 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.61 
 
 
851 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.2 
 
 
849 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.25 
 
 
843 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.41 
 
 
850 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  52.23 
 
 
850 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  52.7 
 
 
850 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  49.91 
 
 
513 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.2 
 
 
842 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  48.63 
 
 
822 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  46.24 
 
 
840 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.53 
 
 
534 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  47.95 
 
 
466 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.2 
 
 
885 aa  359  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.11 
 
 
461 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  43.08 
 
 
844 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.77 
 
 
892 aa  339  7e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.64 
 
 
840 aa  330  6e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.34 
 
 
849 aa  329  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  42.09 
 
 
783 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 
844 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  35.23 
 
 
1257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32 
 
 
613 aa  206  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  34.47 
 
 
1338 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.37 
 
 
582 aa  203  8e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  28 
 
 
623 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  33.4 
 
 
1357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  32.16 
 
 
588 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.43 
 
 
595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.16 
 
 
588 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.61 
 
 
600 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  32.44 
 
 
1313 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.48 
 
 
614 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.44 
 
 
607 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.24 
 
 
595 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.55 
 
 
613 aa  196  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.8 
 
 
589 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.24 
 
 
595 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  29.26 
 
 
969 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.52 
 
 
612 aa  195  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.21 
 
 
607 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  29.5 
 
 
1407 aa  194  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  33.02 
 
 
1341 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.81 
 
 
600 aa  193  8e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  29.53 
 
 
628 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.73 
 
 
593 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29 
 
 
629 aa  190  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29 
 
 
626 aa  190  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.2 
 
 
594 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  28.07 
 
 
631 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  27.78 
 
 
613 aa  188  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.63 
 
 
610 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  28.18 
 
 
608 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.76 
 
 
591 aa  187  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.48 
 
 
1401 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  30.34 
 
 
1409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  31.84 
 
 
1397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.77 
 
 
594 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  31.66 
 
 
1397 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  27.89 
 
 
614 aa  183  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  28.91 
 
 
602 aa  183  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  31.31 
 
 
883 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  29.17 
 
 
599 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  29.17 
 
 
599 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.52 
 
 
589 aa  180  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.98 
 
 
608 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.47 
 
 
1395 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.23 
 
 
1427 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  28.99 
 
 
599 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.04 
 
 
1418 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
1403 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  31.28 
 
 
1405 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.85 
 
 
599 aa  178  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.19 
 
 
610 aa  177  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 
1400 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.85 
 
 
599 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  30.86 
 
 
1418 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.86 
 
 
1418 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.86 
 
 
1418 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.86 
 
 
1418 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.93 
 
 
1271 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.36 
 
 
509 aa  176  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.93 
 
 
1271 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  30.86 
 
 
1398 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  30.86 
 
 
1418 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.22 
 
 
596 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.93 
 
 
1271 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  28.4 
 
 
599 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.65 
 
 
584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 
1342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  33.01 
 
 
1232 aa  174  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.41 
 
 
598 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.67 
 
 
599 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.62 
 
 
604 aa  173  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.67 
 
 
599 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.95 
 
 
604 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>