More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0860 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 849 aa  1713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  50.65 
 
 		 783 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  63.03 
 
 		 822 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  63.69 
 
 		 840 aa  1090    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  97.88 
 
 		 850 aa  1681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.49 
 
 		 840 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  65.11 
 
 		 850 aa  1054    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.71 
 
 		 842 aa  1157    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.37 
 
 		 843 aa  1068    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  46.84 
 
 		 844 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  89.88 
 
 		 851 aa  1563    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  93.53 
 
 		 850 aa  1617    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  64.87 
 
 		 850 aa  1058    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.01 
 
 		 885 aa  628  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.87 
 
 		 849 aa  611  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.94 
 
 		 892 aa  598  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.02 
 
 		 844 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  51.19 
 
 		 533 aa  436  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.57 
 
 		 521 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  50.1 
 
 		 513 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  49.46 
 
 		 511 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.71 
 
 		 526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.88 
 
 		 534 aa  363  8e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.69 
 
 		 461 aa  342  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  39.38 
 
 		 380 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  39.38 
 
 		 380 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  39.41 
 
 		 381 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  35.29 
 
 		 397 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  37.87 
 
 		 388 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  58.59 
 
 		 466 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  33.16 
 
 		 381 aa  212  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  35.63 
 
 		 1257 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  31.08 
 
 		 1312 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  38.61 
 
 		 398 aa  206  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  32.84 
 
 		 1397 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  36.34 
 
 		 398 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 		 1397 aa  201  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  33.72 
 
 		 1357 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  32.77 
 
 		 1403 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.83 
 
 		 1395 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.83 
 
 		 1401 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 		 1405 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  34.29 
 
 		 1338 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.34 
 
 		 739 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.34 
 
 		 739 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  33.65 
 
 		 1418 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  33.65 
 
 		 1398 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  33.65 
 
 		 1418 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.4 
 
 		 1418 aa  195  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  31.06 
 
 		 1384 aa  195  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  32.37 
 
 		 1313 aa  195  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.46 
 
 		 1418 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.46 
 
 		 1418 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  33.46 
 
 		 1418 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  33.65 
 
 		 1427 aa  194  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.91 
 
 		 1271 aa  193  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.91 
 
 		 1271 aa  193  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.91 
 
 		 1271 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  32.96 
 
 		 1395 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  32.96 
 
 		 1395 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  32.96 
 
 		 1395 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.02 
 
 		 614 aa  192  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  26.85 
 
 		 734 aa  191  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.29 
 
 		 599 aa  191  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.85 
 
 		 594 aa  190  8e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  28.07 
 
 		 969 aa  190  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  36.17 
 
 		 411 aa  190  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  32.03 
 
 		 1400 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  33.59 
 
 		 1341 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.8 
 
 		 403 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.73 
 
 		 582 aa  188  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  31.51 
 
 		 1370 aa  187  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  27.05 
 
 		 614 aa  187  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.26 
 
 		 599 aa  187  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.28 
 
 		 591 aa  187  9e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.04 
 
 		 594 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.07 
 
 		 599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  30.47 
 
 		 588 aa  185  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.26 
 
 		 613 aa  185  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.89 
 
 		 599 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 		 1396 aa  185  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.47 
 
 		 588 aa  185  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.89 
 
 		 599 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  30.71 
 
 		 608 aa  183  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.76 
 
 		 607 aa  183  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 		 1409 aa  183  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  29.4 
 
 		 1317 aa  182  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 		 1232 aa  182  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 		 1342 aa  181  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  29.35 
 
 		 631 aa  181  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  29.37 
 
 		 602 aa  180  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.73 
 
 		 613 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.35 
 
 		 509 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.15 
 
 		 626 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.15 
 
 		 629 aa  178  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  29.04 
 
 		 1407 aa  177  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  36.43 
 
 		 381 aa  177  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.94 
 
 		 604 aa  177  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.91 
 
 		 598 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.94 
 
 		 605 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>