200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1779 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 
398 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  63.27 
 
 
398 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  62.41 
 
 
403 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  61.58 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  48.77 
 
 
381 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  43.93 
 
 
397 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  46.7 
 
 
388 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.8 
 
 
849 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.46 
 
 
850 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.6 
 
 
850 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.7 
 
 
851 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  39.9 
 
 
380 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  39.9 
 
 
380 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.03 
 
 
842 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  39.89 
 
 
783 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  42.23 
 
 
381 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 
843 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  37.63 
 
 
840 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  38.71 
 
 
850 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  39.19 
 
 
844 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  38.17 
 
 
850 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  37.07 
 
 
822 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.01 
 
 
849 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  29.26 
 
 
381 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.86 
 
 
844 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.78 
 
 
840 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  34.47 
 
 
885 aa  157  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.72 
 
 
892 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.4 
 
 
369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  31.45 
 
 
371 aa  123  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  30.08 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4558  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.37 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  23.76 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.06 
 
 
425 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  26.37 
 
 
405 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.69 
 
 
385 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  25 
 
 
394 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  22.95 
 
 
459 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4297  PepSY-associated TM helix domain protein  23.63 
 
 
410 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984499  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  22.34 
 
 
372 aa  96.3  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.45 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  26.61 
 
 
388 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  21.58 
 
 
374 aa  89  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  23.51 
 
 
384 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  23.35 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  26.84 
 
 
489 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  28.53 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  21.54 
 
 
385 aa  86.3  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  33.62 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  34.6 
 
 
491 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  25.85 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  26.13 
 
 
360 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  33.76 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2283  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.12 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.882817  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  22.61 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  26.44 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  24.19 
 
 
379 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  27.2 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  26.9 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  21.96 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  25.73 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4625  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.93 
 
 
512 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0791517  normal  0.93462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  26.46 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2870  putative integral membrane protein  25.19 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  23.53 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0153  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.1 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  25.73 
 
 
455 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  24.82 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  26.21 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  25.37 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3413  hypothetical protein  26.15 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1810  PepSY-associated TM helix family protein  24.21 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2883  hypothetical protein  24.82 
 
 
450 aa  68.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0901265  hitchhiker  0.000521416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3148  PepSY-associated TM helix domain protein  28.57 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11538  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2923  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.71 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  25.72 
 
 
457 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  22.69 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0237  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.95 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.68 
 
 
456 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 
1117 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0244  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.02 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.03 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.53 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3047  PepSY-associated TM helix domain protein  28.03 
 
 
456 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136247  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  26.94 
 
 
411 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0572  PepSY-associated TM helix domain protein  26.82 
 
 
458 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  24.14 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  25 
 
 
451 aa  63.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0226  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.97 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  24.41 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4267  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  19.28 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.230745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.22 
 
 
533 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  27.78 
 
 
538 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1326  hypothetical protein  27.23 
 
 
471 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3144  sulfite reductase  27.2 
 
 
456 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3266  hypothetical protein  27.32 
 
 
479 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.634571  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2514  PepSY-associated TM helix domain protein  22.31 
 
 
437 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  29.05 
 
 
457 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.98 
 
 
539 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  30.88 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>