More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4569 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.03 
 
 
849 aa  1061    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  100 
 
 
822 aa  1663    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  80.29 
 
 
840 aa  1340    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  67.11 
 
 
842 aa  1109    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.03 
 
 
850 aa  1063    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  62.14 
 
 
850 aa  985    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.67 
 
 
850 aa  1048    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.37 
 
 
843 aa  956    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  46.66 
 
 
844 aa  689    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  61.42 
 
 
850 aa  980    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.75 
 
 
851 aa  1070    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.37 
 
 
840 aa  630  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.34 
 
 
885 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.93 
 
 
892 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  44.59 
 
 
783 aa  568  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.6 
 
 
849 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.72 
 
 
844 aa  487  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  52.27 
 
 
511 aa  439  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  48.94 
 
 
521 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  52.08 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  48.63 
 
 
533 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.64 
 
 
526 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.46 
 
 
534 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.98 
 
 
461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.14 
 
 
1313 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.64 
 
 
1401 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  58.59 
 
 
466 aa  217  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  34.1 
 
 
1257 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.74 
 
 
613 aa  216  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 
1403 aa  213  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 
1400 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  31.03 
 
 
1409 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  36.87 
 
 
380 aa  211  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  36.87 
 
 
380 aa  211  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  36.02 
 
 
1338 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.83 
 
 
613 aa  206  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  31.96 
 
 
1397 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  34.59 
 
 
1342 aa  205  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  33.46 
 
 
1370 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  32.52 
 
 
1397 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.15 
 
 
1395 aa  203  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  31.9 
 
 
1418 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 
1405 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  38.29 
 
 
381 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  31.9 
 
 
1398 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  31.9 
 
 
1418 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.72 
 
 
1418 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  30.73 
 
 
602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.72 
 
 
1418 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.72 
 
 
1418 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.72 
 
 
1418 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  34.09 
 
 
1357 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  31.91 
 
 
1396 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.9 
 
 
1427 aa  200  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  32.4 
 
 
588 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  31.33 
 
 
599 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  31.14 
 
 
599 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  30.51 
 
 
969 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.4 
 
 
588 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  31.33 
 
 
599 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.78 
 
 
607 aa  198  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 
1407 aa  197  6e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.77 
 
 
594 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.96 
 
 
607 aa  197  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.83 
 
 
605 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.43 
 
 
584 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.84 
 
 
591 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.5 
 
 
600 aa  196  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.89 
 
 
600 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  31.78 
 
 
1395 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  31.78 
 
 
1395 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  31.78 
 
 
1395 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  30.96 
 
 
599 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.96 
 
 
599 aa  194  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 
1341 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  31.14 
 
 
599 aa  194  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  30.96 
 
 
599 aa  194  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  30.96 
 
 
599 aa  194  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.9 
 
 
614 aa  194  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  30.96 
 
 
599 aa  194  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  30.96 
 
 
599 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  30.96 
 
 
599 aa  193  9e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  31.07 
 
 
1405 aa  193  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  33.03 
 
 
1394 aa  193  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  28.02 
 
 
608 aa  192  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.77 
 
 
608 aa  192  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  30.77 
 
 
599 aa  192  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  30.77 
 
 
599 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  30.58 
 
 
599 aa  191  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.43 
 
 
1232 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  34.23 
 
 
397 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.14 
 
 
599 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  33.52 
 
 
381 aa  187  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.31 
 
 
595 aa  187  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.39 
 
 
599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.39 
 
 
599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.71 
 
 
594 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.39 
 
 
599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.39 
 
 
599 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  30.54 
 
 
600 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>