More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5028 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
849 aa  1681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.45 
 
 
849 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  45.37 
 
 
850 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.4 
 
 
850 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.06 
 
 
851 aa  642    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.11 
 
 
842 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.4 
 
 
885 aa  749    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.42 
 
 
843 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  45.25 
 
 
850 aa  655    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.57 
 
 
850 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.89 
 
 
892 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  44.24 
 
 
840 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  43.32 
 
 
822 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  42.82 
 
 
783 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  41.64 
 
 
844 aa  544  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.1 
 
 
840 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.38 
 
 
844 aa  438  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  48.29 
 
 
511 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.51 
 
 
521 aa  354  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.49 
 
 
526 aa  354  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  46.6 
 
 
466 aa  350  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  45.55 
 
 
533 aa  347  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.3 
 
 
461 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  44.38 
 
 
513 aa  335  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.53 
 
 
534 aa  317  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  37.83 
 
 
380 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  37.83 
 
 
380 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  39.79 
 
 
381 aa  229  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  35.34 
 
 
1257 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  34.48 
 
 
1357 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  35.19 
 
 
1338 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  34.17 
 
 
1341 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  37.53 
 
 
397 aa  208  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  34.57 
 
 
1342 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.55 
 
 
588 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  30.55 
 
 
588 aa  192  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  33.04 
 
 
1370 aa  191  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  30.73 
 
 
381 aa  191  7e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 
1409 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.28 
 
 
599 aa  187  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  35.64 
 
 
398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.44 
 
 
600 aa  184  6e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  32.44 
 
 
1394 aa  183  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  31.91 
 
 
1312 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  30.83 
 
 
1400 aa  181  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.78 
 
 
604 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.6 
 
 
604 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  31.72 
 
 
1397 aa  179  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.73 
 
 
591 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  32.34 
 
 
1405 aa  178  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.78 
 
 
604 aa  178  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.41 
 
 
1395 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.59 
 
 
582 aa  177  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.95 
 
 
607 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  28.34 
 
 
584 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 
1232 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.53 
 
 
403 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.29 
 
 
610 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.17 
 
 
614 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  32.49 
 
 
1313 aa  176  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  35.1 
 
 
388 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  28.25 
 
 
602 aa  174  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  26.29 
 
 
969 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.71 
 
 
589 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  28.34 
 
 
607 aa  172  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.05 
 
 
1271 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.11 
 
 
1418 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.05 
 
 
1271 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.05 
 
 
1271 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  26.57 
 
 
628 aa  170  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  31.11 
 
 
1398 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  31.11 
 
 
1418 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  32.04 
 
 
1395 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.11 
 
 
1418 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  31.11 
 
 
1418 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.11 
 
 
1418 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.11 
 
 
1418 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  32.04 
 
 
1395 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  32.04 
 
 
1395 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.1 
 
 
594 aa  168  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.48 
 
 
1427 aa  168  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.21 
 
 
613 aa  168  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  28.6 
 
 
599 aa  168  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  28.33 
 
 
631 aa  167  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.7 
 
 
594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  28.23 
 
 
599 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  28.12 
 
 
599 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.07 
 
 
613 aa  164  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  30.62 
 
 
1317 aa  164  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  36.59 
 
 
398 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.31 
 
 
596 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.49 
 
 
598 aa  162  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  27.27 
 
 
623 aa  162  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.41 
 
 
608 aa  161  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.16 
 
 
735 aa  161  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  33.5 
 
 
411 aa  161  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.28 
 
 
629 aa  160  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.28 
 
 
626 aa  160  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.89 
 
 
599 aa  160  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  28.12 
 
 
599 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>