More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0793 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 		 843 aa  1687    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.37 
 
 		 849 aa  1068    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  59.37 
 
 		 822 aa  941    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  60.71 
 
 		 840 aa  994    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  62.94 
 
 		 850 aa  994    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.06 
 
 		 850 aa  1066    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.17 
 
 		 842 aa  1043    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.65 
 
 		 850 aa  1072    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.85 
 
 		 840 aa  663    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  47.79 
 
 		 844 aa  721    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  63.29 
 
 		 850 aa  997    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  63.85 
 
 		 851 aa  1064    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.84 
 
 		 849 aa  623  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.34 
 
 		 885 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  47.18 
 
 		 783 aa  610  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.09 
 
 		 892 aa  556  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.58 
 
 		 844 aa  459  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  54.98 
 
 		 511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  53.36 
 
 		 533 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.71 
 
 		 526 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.07 
 
 		 521 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  51.16 
 
 		 513 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.35 
 
 		 534 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  47.11 
 
 		 466 aa  369  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  45.34 
 
 		 461 aa  336  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  38.66 
 
 		 380 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  38.66 
 
 		 380 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  40.16 
 
 		 381 aa  231  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  36.72 
 
 		 381 aa  223  9e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  35.17 
 
 		 1370 aa  222  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  37.43 
 
 		 397 aa  220  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  35.51 
 
 		 1257 aa  219  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  37.67 
 
 		 388 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  33.83 
 
 		 1397 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.21 
 
 		 1401 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.71 
 
 		 613 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.9 
 
 		 613 aa  212  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  33.27 
 
 		 1397 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  35.95 
 
 		 1338 aa  211  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 		 1400 aa  209  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.08 
 
 		 1395 aa  206  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  32.21 
 
 		 1403 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  32.3 
 
 		 614 aa  204  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 1405 aa  204  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.85 
 
 		 1418 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.85 
 
 		 1418 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.85 
 
 		 1418 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  32.85 
 
 		 1418 aa  203  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  29.48 
 
 		 969 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  33.58 
 
 		 1427 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  35.35 
 
 		 1357 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  32.67 
 
 		 1418 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  32.67 
 
 		 1398 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  32.67 
 
 		 1418 aa  201  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  31.1 
 
 		 602 aa  201  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  32.39 
 
 		 1312 aa  201  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  34.97 
 
 		 1341 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 		 1313 aa  198  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 1395 aa  197  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 1395 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 1395 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  30.52 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 		 1407 aa  196  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  30.73 
 
 		 599 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  30.83 
 
 		 1384 aa  194  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  30.52 
 
 		 599 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  30.55 
 
 		 1409 aa  194  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  33.03 
 
 		 1394 aa  192  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.4 
 
 		 582 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  30.15 
 
 		 599 aa  191  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.04 
 
 		 610 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  30 
 
 		 599 aa  189  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  30.15 
 
 		 631 aa  189  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  30 
 
 		 599 aa  189  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  30 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  29.81 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  30 
 
 		 599 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  30 
 
 		 599 aa  189  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  32.84 
 
 		 1396 aa  188  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  31.29 
 
 		 1405 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  29.81 
 
 		 599 aa  187  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  29.78 
 
 		 599 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  37.03 
 
 		 398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.8 
 
 		 588 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  30.8 
 
 		 588 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  29.63 
 
 		 599 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  33.59 
 
 		 1342 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.49 
 
 		 1271 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.49 
 
 		 1271 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  34.49 
 
 		 398 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.49 
 
 		 1271 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  29.32 
 
 		 628 aa  184  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.15 
 
 		 600 aa  184  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.74 
 
 		 600 aa  183  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  29.91 
 
 		 623 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  31.68 
 
 		 615 aa  182  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  35.5 
 
 		 403 aa  181  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.24 
 
 		 584 aa  180  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.68 
 
 		 1232 aa  180  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>