More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02133 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0752  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  69.48 
 
 
612 aa  839    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0839  NADPH-sulfite reductase flavoprotein subunit  69.16 
 
 
612 aa  837    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.305761  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  100 
 
 
615 aa  1228    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  46.41 
 
 
610 aa  525  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  44.08 
 
 
608 aa  487  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  43.94 
 
 
614 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.96 
 
 
613 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.23 
 
 
591 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  42.09 
 
 
623 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.84 
 
 
594 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  45.05 
 
 
599 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  46.57 
 
 
602 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.39 
 
 
599 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  43 
 
 
607 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  45 
 
 
613 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  42.83 
 
 
631 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.02 
 
 
596 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.21 
 
 
607 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.18 
 
 
607 aa  464  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.14 
 
 
599 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.49 
 
 
599 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.56 
 
 
599 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.55 
 
 
598 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.9 
 
 
594 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.97 
 
 
599 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  42.44 
 
 
613 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  43.17 
 
 
609 aa  462  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  43.5 
 
 
599 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  42.97 
 
 
609 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  43.04 
 
 
599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.88 
 
 
599 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  43.04 
 
 
599 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  42.79 
 
 
599 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  42.88 
 
 
599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  43.04 
 
 
599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  42.88 
 
 
599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  42.97 
 
 
599 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.63 
 
 
604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  43.04 
 
 
599 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  43.96 
 
 
612 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  42.97 
 
 
599 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  42.81 
 
 
599 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.42 
 
 
605 aa  450  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.51 
 
 
604 aa  449  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  42.62 
 
 
599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  42.58 
 
 
601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  42.62 
 
 
599 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  42.46 
 
 
599 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  40.46 
 
 
595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.14 
 
 
604 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.6 
 
 
600 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.17 
 
 
608 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  42.86 
 
 
600 aa  428  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  42.86 
 
 
600 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  42.2 
 
 
612 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.36 
 
 
610 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  41.88 
 
 
588 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 
588 aa  415  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.19 
 
 
600 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  35.9 
 
 
614 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  38.13 
 
 
969 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  42.78 
 
 
883 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  37.13 
 
 
1405 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.83 
 
 
584 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.49 
 
 
1401 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  41.23 
 
 
1257 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  38.98 
 
 
628 aa  361  3e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  43.07 
 
 
1338 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  38.99 
 
 
1400 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1803  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.1 
 
 
593 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.336845  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  36.93 
 
 
1397 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.62 
 
 
1395 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  36.93 
 
 
1397 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.51 
 
 
589 aa  355  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  39.75 
 
 
1403 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  38.37 
 
 
1384 aa  353  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.7 
 
 
626 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.7 
 
 
629 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.7 
 
 
1383 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  41.76 
 
 
1357 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  39.59 
 
 
1398 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  36.16 
 
 
1409 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  35.84 
 
 
1407 aa  347  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.25 
 
 
595 aa  347  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  37.09 
 
 
1395 aa  346  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  39.46 
 
 
1395 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  39.46 
 
 
1395 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  40.47 
 
 
1418 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  40.47 
 
 
1418 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  40.47 
 
 
1418 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  40.47 
 
 
1418 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  40.47 
 
 
1418 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  40.47 
 
 
1418 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  41.58 
 
 
1341 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  40.11 
 
 
1427 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.76 
 
 
595 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.6 
 
 
595 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.7 
 
 
582 aa  334  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  39.89 
 
 
1396 aa  330  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1784  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.17 
 
 
589 aa  330  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.108282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>