More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4088 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4088  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  100 
 
 
725 aa  1421    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.265737  normal  0.143832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3436  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  98.62 
 
 
725 aa  1405    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.129354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  44.57 
 
 
734 aa  625  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45 
 
 
735 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5389  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.23 
 
 
732 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2738  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.04 
 
 
726 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  44.84 
 
 
736 aa  568  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0493  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  44.4 
 
 
779 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1981  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  44.4 
 
 
779 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2078  oxidoreductase NAD-binding/FAD-binding  43.97 
 
 
782 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0900  nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component, putative  45.06 
 
 
756 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.638423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1291  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.19 
 
 
739 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3213  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.19 
 
 
739 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4965  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.39 
 
 
730 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.969673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3395  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.48 
 
 
732 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0272  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.05 
 
 
740 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0226  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
736 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180249  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.27 
 
 
728 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1598  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.72 
 
 
725 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.80614 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0676  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  44.41 
 
 
653 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273714  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0564  sulfite reductase, alpha subunit  44.41 
 
 
653 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0948792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1665  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.67 
 
 
732 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.81 
 
 
727 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.91 
 
 
718 aa  264  4e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  31.9 
 
 
783 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0660  ApbE-like lipoprotein  34.66 
 
 
800 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.121438 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  26.62 
 
 
840 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.44 
 
 
851 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  31.57 
 
 
513 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.67 
 
 
850 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.25 
 
 
850 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.11 
 
 
849 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.56 
 
 
844 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.81 
 
 
842 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.89 
 
 
843 aa  140  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.68 
 
 
461 aa  140  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  26.46 
 
 
850 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  32.05 
 
 
466 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  30.5 
 
 
534 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2225  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.38 
 
 
509 aa  123  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.653659  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.46 
 
 
730 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.21 
 
 
822 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  26.83 
 
 
735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.02 
 
 
840 aa  117  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  31.67 
 
 
1065 aa  109  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  31.67 
 
 
1065 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  31.67 
 
 
1065 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  31.67 
 
 
1065 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  31.67 
 
 
1065 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  31.22 
 
 
1065 aa  107  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.77 
 
 
1065 aa  105  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  29.86 
 
 
1065 aa  104  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.32 
 
 
1006 aa  104  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  30.32 
 
 
1065 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  31.16 
 
 
614 aa  103  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  39.2 
 
 
1072 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.69 
 
 
526 aa  101  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  35.18 
 
 
1075 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6638  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.37 
 
 
393 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297273  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  35.59 
 
 
1074 aa  94.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  36.95 
 
 
511 aa  94.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.56 
 
 
1232 aa  94  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.11 
 
 
600 aa  94  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  27.1 
 
 
521 aa  92.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.7 
 
 
607 aa  91.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  36.5 
 
 
850 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  32.61 
 
 
628 aa  91.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  38.12 
 
 
1096 aa  91.3  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  29.87 
 
 
1395 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  29.87 
 
 
1395 aa  90.1  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  29.87 
 
 
1395 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.47 
 
 
1418 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55602  NADPH-ferrihemoprotein reductase  31.51 
 
 
603 aa  89.4  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1893  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31 
 
 
365 aa  89.7  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  31.47 
 
 
1418 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  35.98 
 
 
588 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.47 
 
 
1418 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.47 
 
 
1418 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  31.47 
 
 
1398 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.9 
 
 
1427 aa  89  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.98 
 
 
588 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  31.47 
 
 
1418 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  31.47 
 
 
1418 aa  89  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  26.55 
 
 
844 aa  88.6  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.28 
 
 
1395 aa  88.2  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.48 
 
 
1401 aa  87.4  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  30.6 
 
 
609 aa  87.4  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  31.44 
 
 
599 aa  87.4  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  29.54 
 
 
623 aa  86.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  30.28 
 
 
526 aa  87  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.3 
 
 
629 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  28.08 
 
 
539 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.3 
 
 
626 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2801  flavodoxin/nitric oxide synthase  33.77 
 
 
582 aa  86.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.310808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  29.74 
 
 
609 aa  86.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  31.94 
 
 
602 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0719  oxidoreductase, FAD-binding  31.22 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  32.19 
 
 
1403 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  29.71 
 
 
613 aa  85.5  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 
1400 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>