More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1753 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  87.2 
 
 		 539 aa  958    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  100 
 
 		 539 aa  1102    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  61 
 
 		 526 aa  635    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  66.36 
 
 		 535 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  59.38 
 
 		 537 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  59.6 
 
 		 540 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2498  sulfite reductase  60.07 
 
 		 542 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  60.33 
 
 		 534 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  57.86 
 
 		 534 aa  609  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  57.86 
 
 		 534 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  57.38 
 
 		 535 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  44.2 
 
 		 554 aa  438  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.8 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  45.43 
 
 		 1409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  47.31 
 
 		 659 aa  313  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.42 
 
 		 607 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  46.77 
 
 		 388 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 		 1407 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  45.43 
 
 		 883 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  46.76 
 
 		 628 aa  303  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  44.62 
 
 		 376 aa  301  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  44.92 
 
 		 1397 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  37.56 
 
 		 1342 aa  299  9e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  44.67 
 
 		 1397 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  45.14 
 
 		 1405 aa  297  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  45.53 
 
 		 1401 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  44.16 
 
 		 1395 aa  295  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  43.6 
 
 		 1403 aa  295  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.38 
 
 		 600 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  42.17 
 
 		 599 aa  294  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  41.23 
 
 		 1384 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  42.17 
 
 		 599 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  42.17 
 
 		 599 aa  293  6e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  41.93 
 
 		 599 aa  292  9e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  42.17 
 
 		 599 aa  292  9e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  42.17 
 
 		 599 aa  292  9e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.93 
 
 		 599 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  38.42 
 
 		 1400 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  42.17 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  41.93 
 
 		 599 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.27 
 
 		 613 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  42.41 
 
 		 1427 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.32 
 
 		 613 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  39.1 
 
 		 1418 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  40.82 
 
 		 599 aa  289  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  39.1 
 
 		 1418 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.61 
 
 		 1418 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  39.1 
 
 		 1398 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.61 
 
 		 1418 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.61 
 
 		 1418 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  38.61 
 
 		 1418 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  40.58 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  40.34 
 
 		 599 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  40.1 
 
 		 599 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  40.34 
 
 		 599 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  43.65 
 
 		 1395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  43.65 
 
 		 1395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  43.65 
 
 		 1395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  40.34 
 
 		 601 aa  283  7.000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.54 
 
 		 1383 aa  282  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.4 
 
 		 600 aa  281  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  41.38 
 
 		 599 aa  279  8e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.04 
 
 		 607 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  41.33 
 
 		 613 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.22 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  45.01 
 
 		 1396 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.74 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  42.18 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  42.18 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  42.18 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  40.89 
 
 		 609 aa  271  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  39.7 
 
 		 1257 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  38.54 
 
 		 608 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.2 
 
 		 608 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  40.62 
 
 		 609 aa  270  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.58 
 
 		 610 aa  269  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  43.08 
 
 		 1405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  36.27 
 
 		 595 aa  268  2.9999999999999995e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  33.58 
 
 		 631 aa  267  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  40.25 
 
 		 1357 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  43.16 
 
 		 1313 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.89 
 
 		 626 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.89 
 
 		 629 aa  265  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  35.51 
 
 		 614 aa  265  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  40.74 
 
 		 1394 aa  263  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  44.3 
 
 		 1341 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.72 
 
 		 589 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  41.18 
 
 		 1232 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.68 
 
 		 599 aa  262  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  39.2 
 
 		 623 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.25 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  39.19 
 
 		 1338 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.84 
 
 		 604 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.81 
 
 		 614 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.79 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.85 
 
 		 591 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  39.63 
 
 		 602 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.62 
 
 		 604 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  40.96 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  40.96 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>