More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4232 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  66.73 
 
 		 535 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  100 
 
 		 539 aa  1104    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  87.2 
 
 		 539 aa  960    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  60.26 
 
 		 526 aa  632  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  59.78 
 
 		 540 aa  627  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  59.19 
 
 		 537 aa  625  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  60.07 
 
 		 534 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  59.04 
 
 		 534 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  59.04 
 
 		 534 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  58.12 
 
 		 535 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2498  sulfite reductase  60.22 
 
 		 542 aa  618  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  42.75 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  46.55 
 
 		 659 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  43.11 
 
 		 1409 aa  310  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  44.91 
 
 		 883 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  45.5 
 
 		 584 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  45.85 
 
 		 388 aa  302  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  40.88 
 
 		 1407 aa  302  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  44.92 
 
 		 1397 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  44.92 
 
 		 1397 aa  301  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  44.62 
 
 		 1405 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  44.44 
 
 		 1395 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.75 
 
 		 600 aa  296  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.89 
 
 		 607 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  36.65 
 
 		 1342 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  44.07 
 
 		 1401 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  40.98 
 
 		 1427 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  43.38 
 
 		 1403 aa  293  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  42.47 
 
 		 376 aa  291  3e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  44.86 
 
 		 628 aa  291  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  39.86 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  40.1 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  43.67 
 
 		 1418 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 		 1395 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 		 1395 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  44.19 
 
 		 1395 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  39.86 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  39.86 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  39.86 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.67 
 
 		 1418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.67 
 
 		 1418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  39.78 
 
 		 1384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.67 
 
 		 1418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.07 
 
 		 613 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  43.67 
 
 		 1418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  39.86 
 
 		 599 aa  287  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  39.86 
 
 		 599 aa  287  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  43.67 
 
 		 1398 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  43.67 
 
 		 1418 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.61 
 
 		 599 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  39.61 
 
 		 599 aa  286  9e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  43.15 
 
 		 1400 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.13 
 
 		 613 aa  282  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  38.89 
 
 		 599 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  38.99 
 
 		 599 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.98 
 
 		 1383 aa  278  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  43.41 
 
 		 1357 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  38.48 
 
 		 599 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  41.75 
 
 		 1257 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  38.48 
 
 		 599 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  43.17 
 
 		 1338 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  38.46 
 
 		 601 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  38.73 
 
 		 599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.78 
 
 		 600 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  39.6 
 
 		 599 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  39.43 
 
 		 613 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  43.59 
 
 		 1396 aa  269  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  39.61 
 
 		 612 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  43.19 
 
 		 1341 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  39.6 
 
 		 600 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  40.91 
 
 		 1405 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.85 
 
 		 607 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  39.6 
 
 		 600 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.62 
 
 		 599 aa  265  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.27 
 
 		 610 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40 
 
 		 608 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.68 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  39.27 
 
 		 609 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  36.9 
 
 		 595 aa  263  6.999999999999999e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  41.15 
 
 		 1394 aa  262  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  41.29 
 
 		 1313 aa  262  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  40.66 
 
 		 1232 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  38.48 
 
 		 609 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  35.61 
 
 		 608 aa  261  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  36.76 
 
 		 612 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.5 
 
 		 629 aa  259  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.5 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2194  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.59 
 
 		 595 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  37.29 
 
 		 631 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2236  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.2 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680816  normal  0.170477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2512  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.2 
 
 		 595 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.41 
 
 		 589 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.35 
 
 		 594 aa  256  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.44 
 
 		 604 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  39.04 
 
 		 602 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  34.05 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  37.6 
 
 		 623 aa  254  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.44 
 
 		 604 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.9 
 
 		 591 aa  253  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  36.53 
 
 		 614 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>