More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3056 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  100 
 
 
554 aa  1147    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  44.12 
 
 
535 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  42.42 
 
 
540 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  43.84 
 
 
539 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  42.81 
 
 
539 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  42.42 
 
 
537 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2498  sulfite reductase  44.02 
 
 
542 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  42.65 
 
 
534 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  41.74 
 
 
526 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  41.59 
 
 
534 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  41.24 
 
 
535 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  41.59 
 
 
534 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  51.47 
 
 
659 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  46.89 
 
 
1409 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  47.41 
 
 
1407 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  46.13 
 
 
607 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.82 
 
 
584 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  46.03 
 
 
599 aa  339  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  46.3 
 
 
599 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  46.03 
 
 
599 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  46.03 
 
 
599 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  46.03 
 
 
599 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  46.03 
 
 
599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  45.77 
 
 
599 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  46.03 
 
 
599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  45.77 
 
 
599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  45.81 
 
 
883 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  44.56 
 
 
599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  45.5 
 
 
599 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.39 
 
 
607 aa  335  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  35.56 
 
 
599 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  44.97 
 
 
609 aa  334  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  45.24 
 
 
599 aa  333  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  44.44 
 
 
609 aa  332  9e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  44.97 
 
 
599 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  35.38 
 
 
599 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  44.04 
 
 
613 aa  332  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  45.24 
 
 
601 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  45.21 
 
 
605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  42.86 
 
 
631 aa  329  7e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  42.75 
 
 
623 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  42.56 
 
 
614 aa  327  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  41.62 
 
 
595 aa  327  5e-88  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.47 
 
 
600 aa  325  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  44.16 
 
 
612 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.56 
 
 
596 aa  323  3e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  44.16 
 
 
600 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  44.16 
 
 
600 aa  323  4e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  45.58 
 
 
376 aa  322  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  46.63 
 
 
1383 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.73 
 
 
599 aa  320  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  43.62 
 
 
607 aa  317  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  44.62 
 
 
628 aa  316  8e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.64 
 
 
604 aa  316  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.57 
 
 
600 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.38 
 
 
604 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.88 
 
 
599 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.46 
 
 
604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.63 
 
 
610 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  40.57 
 
 
612 aa  313  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  45.77 
 
 
1397 aa  312  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  44.68 
 
 
594 aa  310  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  46.49 
 
 
1357 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  46.05 
 
 
1397 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  45.01 
 
 
1401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.82 
 
 
591 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  45.03 
 
 
1405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  42.04 
 
 
602 aa  306  6e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  45.71 
 
 
1338 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  43.31 
 
 
1403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  41.28 
 
 
608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.08 
 
 
599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.82 
 
 
599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.12 
 
 
599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  45.71 
 
 
1341 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  35.36 
 
 
1398 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43.12 
 
 
599 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  40.16 
 
 
614 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  44.48 
 
 
1427 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.69 
 
 
610 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  45.15 
 
 
1418 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.23 
 
 
594 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.78 
 
 
608 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.21 
 
 
598 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.15 
 
 
1418 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.15 
 
 
1418 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.15 
 
 
1418 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.15 
 
 
1418 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  45.15 
 
 
1418 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  44.85 
 
 
1400 aa  299  8e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  44.3 
 
 
1396 aa  297  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.95 
 
 
1395 aa  297  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  42.23 
 
 
388 aa  296  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  45.28 
 
 
1257 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  45.28 
 
 
1342 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  44.74 
 
 
1395 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  44.74 
 
 
1395 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  44.74 
 
 
1395 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.49 
 
 
629 aa  294  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.49 
 
 
626 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>