More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1784 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  100 
 
 		 526 aa  1071    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  61.7 
 
 		 539 aa  636    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  61.43 
 
 		 539 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2498  sulfite reductase  59.93 
 
 		 542 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  59.35 
 
 		 535 aa  596  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  57.7 
 
 		 537 aa  590  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  55.74 
 
 		 535 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  55.49 
 
 		 534 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  56.16 
 
 		 534 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  56.46 
 
 		 540 aa  579  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  55.12 
 
 		 534 aa  581  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  42.03 
 
 		 554 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.13 
 
 		 600 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  43.58 
 
 		 376 aa  299  8e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  43.51 
 
 		 659 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.24 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  44.41 
 
 		 883 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  39.22 
 
 		 599 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  39.22 
 
 		 599 aa  286  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  39.49 
 
 		 599 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  39.22 
 
 		 599 aa  286  7e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  38.24 
 
 		 1409 aa  286  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  39.22 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.97 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  39.24 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  39.22 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  39.49 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  39.1 
 
 		 599 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.3 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  41.19 
 
 		 628 aa  281  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.95 
 
 		 607 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  38.29 
 
 		 599 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  42.4 
 
 		 1405 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  37.24 
 
 		 1407 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  39.19 
 
 		 601 aa  277  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  38.04 
 
 		 599 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  38.89 
 
 		 599 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  38.29 
 
 		 599 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.27 
 
 		 613 aa  276  9e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  41.76 
 
 		 1397 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  40.8 
 
 		 1400 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  38.07 
 
 		 599 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.33 
 
 		 613 aa  274  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  41.6 
 
 		 1418 aa  272  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  41.22 
 
 		 1397 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.6 
 
 		 1418 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.01 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.6 
 
 		 1418 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  41.6 
 
 		 1398 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  41.6 
 
 		 1418 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.6 
 
 		 1418 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  41.6 
 
 		 1418 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.66 
 
 		 1401 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.83 
 
 		 607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.32 
 
 		 1395 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  41.65 
 
 		 1427 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  39.81 
 
 		 1395 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  38.52 
 
 		 609 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  39.81 
 
 		 1395 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  39.81 
 
 		 1395 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  41.04 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  38.78 
 
 		 612 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  38.78 
 
 		 600 aa  267  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  38.21 
 
 		 609 aa  266  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  38.78 
 
 		 600 aa  266  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  41.13 
 
 		 1403 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.79 
 
 		 610 aa  265  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  38.07 
 
 		 613 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.68 
 
 		 629 aa  263  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.68 
 
 		 626 aa  263  8e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.44 
 
 		 605 aa  261  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  37.1 
 
 		 608 aa  260  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  39.72 
 
 		 1396 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  35.2 
 
 		 631 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.75 
 
 		 608 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  33.11 
 
 		 1342 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  36.29 
 
 		 595 aa  256  5e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.89 
 
 		 604 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  35.31 
 
 		 614 aa  256  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.21 
 
 		 610 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.62 
 
 		 604 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.77 
 
 		 1384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.36 
 
 		 607 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.28 
 
 		 599 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.7 
 
 		 604 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  38.01 
 
 		 623 aa  254  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  34.94 
 
 		 614 aa  253  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  39.85 
 
 		 1257 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.83 
 
 		 599 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.08 
 
 		 599 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  40.1 
 
 		 1357 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  39.71 
 
 		 1338 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.83 
 
 		 599 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  36.83 
 
 		 599 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  39.78 
 
 		 1313 aa  249  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  37.62 
 
 		 602 aa  249  8e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  39.79 
 
 		 1232 aa  249  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.4 
 
 		 596 aa  249  9e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.5 
 
 		 598 aa  247  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>