More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1820 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  38.41 
 
 		 1083 aa  655    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  45.12 
 
 		 1053 aa  923    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.16 
 
 		 1065 aa  971    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.07 
 
 		 1065 aa  974    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.26 
 
 		 1065 aa  976    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  47.26 
 
 		 1065 aa  974    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  46.88 
 
 		 1065 aa  967    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  46.57 
 
 		 1075 aa  904    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.35 
 
 		 1065 aa  979    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  42.62 
 
 		 1063 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.26 
 
 		 1065 aa  976    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  45.7 
 
 		 1071 aa  898    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  55.55 
 
 		 1074 aa  1197    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  87.24 
 
 		 1072 aa  1885    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  100 
 
 		 1075 aa  2202    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  42.21 
 
 		 1064 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  42.8 
 
 		 1079 aa  767    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  46.83 
 
 		 1055 aa  926    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.07 
 
 		 1065 aa  974    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  44.27 
 
 		 1059 aa  841    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  47.16 
 
 		 1065 aa  966    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  42.8 
 
 		 1079 aa  767    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  47.76 
 
 		 1006 aa  936    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  36.7 
 
 		 1096 aa  622  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2584  FAD-binding domain protein  44.78 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.318786  normal  0.0303893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  39.52 
 
 		 486 aa  339  9.999999999999999e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  39.58 
 
 		 458 aa  284  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_46903  predicted protein  32.37 
 
 		 561 aa  251  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.160153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  33.95 
 
 		 1257 aa  244  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.6 
 
 		 613 aa  242  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77786  predicted protein  28.05 
 
 		 675 aa  234  9e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  33.51 
 
 		 1357 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00595  NADPH--cytochrome P450 reductase (Eurofung)  28.41 
 
 		 695 aa  231  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  34.02 
 
 		 628 aa  229  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  32.89 
 
 		 608 aa  229  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9283  predicted protein  30.21 
 
 		 623 aa  226  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101127  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50814  predicted protein  35.64 
 
 		 401 aa  225  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0259055 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 		 1338 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.88 
 
 		 584 aa  224  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  0.00000324313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  33.22 
 
 		 1341 aa  224  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0347  FAD-binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 538 aa  221  6e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.9 
 
 		 607 aa  220  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  33.45 
 
 		 613 aa  219  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44507  predicted protein  31.04 
 
 		 563 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.97 
 
 		 614 aa  213  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.26 
 
 		 1401 aa  213  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.96 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  30.57 
 
 		 464 aa  212  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 1394 aa  211  6e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.31 
 
 		 599 aa  211  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.65 
 
 		 604 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  32.65 
 
 		 602 aa  208  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 1342 aa  207  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02133  sulfite reductase  33.45 
 
 		 615 aa  205  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.887727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 		 1407 aa  205  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01320  electron transporter, putative  27.67 
 
 		 741 aa  204  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  31.39 
 
 		 1384 aa  204  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.97 
 
 		 604 aa  204  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  28.6 
 
 		 1409 aa  204  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.31 
 
 		 599 aa  204  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.94 
 
 		 610 aa  204  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.46 
 
 		 607 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6268  Nitric oxide synthase NOS  30.37 
 
 		 1524 aa  203  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  30.52 
 
 		 1400 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 		 1403 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 		 1396 aa  202  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.73 
 
 		 599 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40283  predicted protein  29.7 
 
 		 633 aa  201  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.98 
 
 		 599 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.82 
 
 		 599 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  30.34 
 
 		 613 aa  200  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.76 
 
 		 604 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.24 
 
 		 629 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.24 
 
 		 626 aa  199  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  32.33 
 
 		 1232 aa  199  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 		 1405 aa  197  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.52 
 
 		 1271 aa  197  7e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.52 
 
 		 1271 aa  197  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.52 
 
 		 1271 aa  197  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.37 
 
 		 600 aa  197  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0665  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.53 
 
 		 594 aa  196  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  29.22 
 
 		 612 aa  196  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  31.43 
 
 		 608 aa  195  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.71 
 
 		 600 aa  195  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.17 
 
 		 1383 aa  195  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  34.35 
 
 		 376 aa  194  6e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  30.02 
 
 		 614 aa  194  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.42 
 
 		 591 aa  194  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  30.52 
 
 		 1397 aa  193  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  29.47 
 
 		 969 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 		 1397 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.29 
 
 		 599 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 659 aa  192  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.8 
 
 		 598 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  31.43 
 
 		 1313 aa  191  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  34.89 
 
 		 539 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  31.67 
 
 		 883 aa  189  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  31.44 
 
 		 446 aa  189  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08004  cytochrome P450, putative (Eurofung)  28.96 
 
 		 469 aa  187  9e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 		 1405 aa  187  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>