More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3962 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  100 
 
 		 486 aa  998    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.51 
 
 		 1065 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.51 
 
 		 1065 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.94 
 
 		 1065 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.94 
 
 		 1065 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  43.29 
 
 		 1065 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  43.51 
 
 		 1065 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.72 
 
 		 1065 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  43.07 
 
 		 1065 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  43.72 
 
 		 1065 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4801  cytochrome P450  50.47 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.788631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  45.97 
 
 		 1006 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  44.67 
 
 		 1064 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  41.33 
 
 		 1053 aa  342  9e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  39.39 
 
 		 1072 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  39.52 
 
 		 1075 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  40.22 
 
 		 1055 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  42.48 
 
 		 1079 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  42.48 
 
 		 1079 aa  333  3e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  40.87 
 
 		 1059 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  40.22 
 
 		 1063 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  37.63 
 
 		 1074 aa  325  8.000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  39.87 
 
 		 1075 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  38.7 
 
 		 1071 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  35.96 
 
 		 1083 aa  266  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  35.13 
 
 		 464 aa  252  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  36.93 
 
 		 1096 aa  246  9e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  34.84 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08004  cytochrome P450, putative (Eurofung)  30.19 
 
 		 469 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  31.95 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.8 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  29.53 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  29.95 
 
 		 454 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  33.77 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  30.87 
 
 		 462 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.02 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  33.42 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  26.92 
 
 		 459 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27.99 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  32.15 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  30 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  29.77 
 
 		 460 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  29.25 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  28.19 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.5 
 
 		 482 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  31.69 
 
 		 465 aa  153  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  29.33 
 
 		 480 aa  153  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  27.79 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  27.49 
 
 		 1373 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  30.37 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  27.49 
 
 		 1380 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  27.27 
 
 		 1373 aa  150  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  27.27 
 
 		 1373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  27.27 
 
 		 1373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  27.27 
 
 		 1373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  27.27 
 
 		 1373 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  27.56 
 
 		 1373 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  30.37 
 
 		 466 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  25.97 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  27.72 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.16 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  31.61 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  31.61 
 
 		 474 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  34.29 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  28.14 
 
 		 461 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  32.15 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  27.09 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  27.02 
 
 		 563 aa  143  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  26.04 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  31.28 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  30.03 
 
 		 457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  29.23 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  31.13 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  29 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  29.4 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  27.87 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  27.7 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  29.59 
 
 		 466 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  28.06 
 
 		 474 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  28.23 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  27.03 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  32.19 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  27.76 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  29.64 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.6 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  27.63 
 
 		 468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  25.06 
 
 		 461 aa  136  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  25.36 
 
 		 495 aa  136  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  30.06 
 
 		 452 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  38.1 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  26.01 
 
 		 1365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  30.2 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  32.93 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  33.24 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  31.37 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  32.49 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  27.91 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  29.77 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  27.15 
 
 		 447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  39.82 
 
 		 469 aa  130  6e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>