More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4009 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  100 
 
 
462 aa  941    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  68.06 
 
 
464 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  63.2 
 
 
466 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  63.36 
 
 
470 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  63.32 
 
 
466 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  47.05 
 
 
464 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  47.25 
 
 
470 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  41.98 
 
 
466 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  41.76 
 
 
467 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  41.98 
 
 
466 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  41.7 
 
 
462 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  44.77 
 
 
465 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  43.01 
 
 
480 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  42.61 
 
 
463 aa  332  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  39.29 
 
 
463 aa  288  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  38.79 
 
 
463 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  37.82 
 
 
453 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  35.27 
 
 
458 aa  256  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  36.28 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  36.28 
 
 
471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  35.51 
 
 
462 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  34.92 
 
 
459 aa  243  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  35.38 
 
 
461 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  36.91 
 
 
460 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  35.02 
 
 
462 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  36.94 
 
 
478 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  36.06 
 
 
459 aa  227  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  35.98 
 
 
452 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  35.61 
 
 
462 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  32.82 
 
 
468 aa  226  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  36.06 
 
 
459 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  30.54 
 
 
462 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  35.1 
 
 
473 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  33.93 
 
 
455 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  34.09 
 
 
457 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  34 
 
 
482 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  32.2 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  34.46 
 
 
470 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  32.03 
 
 
452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  35.98 
 
 
452 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  32.27 
 
 
450 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  31.29 
 
 
458 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  33.02 
 
 
447 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.8 
 
 
446 aa  207  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  28.51 
 
 
453 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.73 
 
 
453 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  31.54 
 
 
466 aa  206  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.73 
 
 
453 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  34.82 
 
 
441 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  34.59 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.47 
 
 
459 aa  200  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  34.7 
 
 
455 aa  199  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  32.81 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  30.98 
 
 
457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  32.84 
 
 
429 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  33.59 
 
 
446 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  30.79 
 
 
431 aa  190  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  30.43 
 
 
484 aa  190  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  30.41 
 
 
433 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.94 
 
 
452 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  32.51 
 
 
445 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  32.01 
 
 
439 aa  186  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  30.84 
 
 
449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  32.6 
 
 
452 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  31.19 
 
 
444 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  28.37 
 
 
432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  28.67 
 
 
445 aa  179  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  30.77 
 
 
460 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  28.64 
 
 
454 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  30.63 
 
 
1380 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  30.39 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  30.75 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  30.05 
 
 
1373 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  30.05 
 
 
1373 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  28.48 
 
 
463 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  31.71 
 
 
437 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  30.05 
 
 
1373 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  30.05 
 
 
1373 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  30.05 
 
 
1373 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  29.25 
 
 
525 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  30.05 
 
 
1373 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.46 
 
 
448 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  30.05 
 
 
1373 aa  172  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  29.79 
 
 
489 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  29.34 
 
 
469 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.37 
 
 
430 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  29.84 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  29.32 
 
 
1365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  27.59 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29.23 
 
 
457 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  28.29 
 
 
451 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  28.02 
 
 
560 aa  158  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  32.84 
 
 
452 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  28.5 
 
 
453 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  27.08 
 
 
563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  28 
 
 
459 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  26.13 
 
 
461 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  29.08 
 
 
474 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  29.08 
 
 
474 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  26.4 
 
 
495 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>