More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0696 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  100 
 
 
470 aa  924    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  72.44 
 
 
462 aa  640    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  70.82 
 
 
466 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  72.44 
 
 
467 aa  634    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  88.96 
 
 
464 aa  805    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  69.96 
 
 
466 aa  630  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  51.64 
 
 
480 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  53.83 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  47.25 
 
 
462 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  45.08 
 
 
464 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  42.67 
 
 
466 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  41.09 
 
 
466 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  41.13 
 
 
470 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  42.32 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  41.16 
 
 
463 aa  303  6.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  40.77 
 
 
461 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  41.61 
 
 
463 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  43.41 
 
 
471 aa  286  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  43.41 
 
 
471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  40.72 
 
 
460 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  40.88 
 
 
462 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  39.25 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  38.04 
 
 
458 aa  272  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  39.22 
 
 
453 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  38.17 
 
 
462 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  37.21 
 
 
459 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  40.05 
 
 
473 aa  258  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  39.82 
 
 
459 aa  257  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  39.37 
 
 
459 aa  256  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  36.03 
 
 
468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  40 
 
 
452 aa  252  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  38.42 
 
 
455 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  40.96 
 
 
452 aa  237  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  34.63 
 
 
462 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  39.82 
 
 
478 aa  236  7e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  35.11 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  38.48 
 
 
482 aa  232  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  34.89 
 
 
459 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  32.96 
 
 
484 aa  224  3e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  34.43 
 
 
458 aa  223  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  32.38 
 
 
452 aa  223  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  37.92 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  34.86 
 
 
1373 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  38.89 
 
 
470 aa  221  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  33.48 
 
 
441 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  34.63 
 
 
1373 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  34.4 
 
 
1380 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  34.63 
 
 
1373 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  35.41 
 
 
444 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  34.63 
 
 
1373 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  34.63 
 
 
1373 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  35.32 
 
 
1365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  34.63 
 
 
1373 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  34.63 
 
 
1373 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  34.15 
 
 
454 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  33.81 
 
 
454 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  39.16 
 
 
452 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  29.69 
 
 
453 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  33.4 
 
 
466 aa  206  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  29.93 
 
 
453 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  29.5 
 
 
453 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  34 
 
 
447 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  32.98 
 
 
432 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  37.26 
 
 
445 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  35.01 
 
 
439 aa  204  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  38.37 
 
 
452 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  35.75 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  30.15 
 
 
457 aa  201  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  36.61 
 
 
453 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  31.98 
 
 
431 aa  199  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  31.61 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  36.06 
 
 
489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.63 
 
 
448 aa  196  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  31.25 
 
 
459 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  32.89 
 
 
449 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  30.09 
 
 
433 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  31.87 
 
 
447 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  36.23 
 
 
429 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  34.41 
 
 
469 aa  194  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  32.4 
 
 
445 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  28.67 
 
 
448 aa  193  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  32.76 
 
 
430 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  38.48 
 
 
455 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  35.55 
 
 
437 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  33.25 
 
 
460 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  33.5 
 
 
449 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  31.72 
 
 
457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  33.33 
 
 
452 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  33.82 
 
 
446 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  31.22 
 
 
546 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  35.11 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  35.11 
 
 
474 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.96 
 
 
445 aa  180  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  34.66 
 
 
457 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  34.84 
 
 
453 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  33.79 
 
 
474 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  34.82 
 
 
1053 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  33.5 
 
 
460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  29 
 
 
451 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  33.42 
 
 
1065 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>