More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2585 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  100 
 
 		 459 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  52.17 
 
 		 463 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  47.57 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  51.72 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  44.44 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  44.22 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  45.96 
 
 		 473 aa  358  9e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  37.39 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  38.06 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  37.21 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  36.82 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  35.55 
 
 		 446 aa  251  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  34.08 
 
 		 466 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  35.43 
 
 		 464 aa  246  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  36.16 
 
 		 466 aa  244  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  36.51 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  35.91 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  35.91 
 
 		 466 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  33.48 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  34.92 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  34.26 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  36.82 
 
 		 480 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  33.41 
 
 		 464 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  34.1 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  36.97 
 
 		 445 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  33.78 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  34.51 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  34.51 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  34.72 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  33.41 
 
 		 466 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.76 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  35.22 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  33.17 
 
 		 460 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  35.55 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  35.81 
 
 		 489 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  32.46 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  33.5 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  32.46 
 
 		 454 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  33.26 
 
 		 462 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  32.16 
 
 		 432 aa  203  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  30.66 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  33.5 
 
 		 447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  33.09 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  31.63 
 
 		 484 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  31.99 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  31.19 
 
 		 455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.18 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  31.87 
 
 		 437 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  27.61 
 
 		 453 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  32.3 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  27.44 
 
 		 453 aa  196  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  30.72 
 
 		 469 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  31.99 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  29.32 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  31.6 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  33.07 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  33.07 
 
 		 431 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  27.44 
 
 		 453 aa  193  5e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  29.37 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.66 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  33.16 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  33.16 
 
 		 474 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  34.47 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  30.94 
 
 		 1365 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  33.5 
 
 		 461 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  31.44 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  32.54 
 
 		 1380 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  30.85 
 
 		 457 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  32.71 
 
 		 1373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  31.76 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  31.1 
 
 		 1373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  31.87 
 
 		 473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  32.44 
 
 		 1373 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  30 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  32.44 
 
 		 1373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  32.44 
 
 		 1373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  32.44 
 
 		 1373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  32.44 
 
 		 1373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  30.75 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  29.02 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  31.05 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  32.77 
 
 		 508 aa  178  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  30.33 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  34.31 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.08 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  32.01 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  29.24 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.57 
 
 		 479 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.97 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  30.45 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.75 
 
 		 446 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  31.03 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  30.05 
 
 		 463 aa  168  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  28.93 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  28.93 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  29.8 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  28.57 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  30.13 
 
 		 459 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  30.54 
 
 		 429 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  31.99 
 
 		 465 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>