More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4969 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  100 
 
 
473 aa  959    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  38.72 
 
 
479 aa  297  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  36.72 
 
 
444 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  34.16 
 
 
446 aa  249  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  38.05 
 
 
445 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  34.62 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  35.27 
 
 
459 aa  238  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  37.92 
 
 
489 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  32.29 
 
 
448 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4834  cytochrome P450  34.4 
 
 
444 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000050774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  34.12 
 
 
447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  35.96 
 
 
445 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  32.81 
 
 
446 aa  213  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  30.92 
 
 
445 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  31.32 
 
 
469 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  32.97 
 
 
482 aa  211  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.31 
 
 
1365 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  34 
 
 
474 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  31.11 
 
 
1373 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  31.47 
 
 
454 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  30.89 
 
 
1373 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  28.79 
 
 
447 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  30.73 
 
 
1373 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  30.73 
 
 
1373 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  30.73 
 
 
1373 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  30.73 
 
 
1373 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  33.26 
 
 
439 aa  206  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  30.73 
 
 
1373 aa  206  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  31.11 
 
 
1380 aa  206  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  32.57 
 
 
460 aa  206  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.7 
 
 
452 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  31.14 
 
 
451 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  34.31 
 
 
457 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  30.04 
 
 
525 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  33.17 
 
 
452 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  32.21 
 
 
452 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  31.87 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  29.43 
 
 
455 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  29.06 
 
 
433 aa  186  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  31.89 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  29.93 
 
 
441 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  31.15 
 
 
453 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  32.27 
 
 
508 aa  177  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  28.85 
 
 
459 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  29.02 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.84 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  30.23 
 
 
474 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  30.23 
 
 
474 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  29.97 
 
 
453 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  33.1 
 
 
441 aa  169  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.96 
 
 
432 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  29.36 
 
 
546 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.57 
 
 
453 aa  166  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  29.67 
 
 
492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  28.15 
 
 
452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  29.76 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  27.81 
 
 
453 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  27.61 
 
 
462 aa  164  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  28.84 
 
 
455 aa  163  7e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.06 
 
 
453 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  30.09 
 
 
429 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  26.73 
 
 
459 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  29.27 
 
 
452 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  28.38 
 
 
463 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  29.31 
 
 
457 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  30.53 
 
 
448 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  29.31 
 
 
458 aa  159  9e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  26.75 
 
 
461 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  30.6 
 
 
461 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  29.89 
 
 
479 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  30.39 
 
 
1064 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  31.7 
 
 
463 aa  156  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  27.27 
 
 
551 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  30.52 
 
 
465 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  30.11 
 
 
462 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  30.23 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  30.56 
 
 
470 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  29.61 
 
 
1053 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  28.6 
 
 
462 aa  152  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  28 
 
 
457 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  29.4 
 
 
437 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  30.12 
 
 
467 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  28.61 
 
 
452 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  29.68 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  28.6 
 
 
468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  30.12 
 
 
466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  29.16 
 
 
484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  29.66 
 
 
471 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  29.48 
 
 
466 aa  146  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  30 
 
 
462 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  27.86 
 
 
453 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  31.39 
 
 
457 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  26.88 
 
 
452 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  29.66 
 
 
471 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  30.38 
 
 
463 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  25.37 
 
 
448 aa  143  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  25 
 
 
447 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  28.07 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  28.07 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  28.1 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>