More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1455 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  100 
 
 		 452 aa  917    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  68.65 
 
 		 449 aa  608  1e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  64.67 
 
 		 458 aa  569  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  62.28 
 
 		 449 aa  529  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  42.89 
 
 		 462 aa  353  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  36.42 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  36.2 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  35.92 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  35.62 
 
 		 457 aa  282  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  36.18 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  33.41 
 
 		 462 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  34.45 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  33.84 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  32.67 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  33.04 
 
 		 466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  34.06 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  32.97 
 
 		 464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.92 
 
 		 468 aa  220  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  32.37 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  32.82 
 
 		 460 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  32.59 
 
 		 466 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  34.58 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  32.38 
 
 		 470 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  35.28 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  31.95 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.46 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  32.09 
 
 		 482 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  30.5 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  31.37 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  31.78 
 
 		 462 aa  203  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  32.18 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.5 
 
 		 459 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  32.84 
 
 		 463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  32.05 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  32.27 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  31.37 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  30.43 
 
 		 464 aa  196  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  31.02 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  30.61 
 
 		 484 aa  194  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  30.66 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  29.31 
 
 		 470 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  32.53 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  34.19 
 
 		 478 aa  190  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  32.34 
 
 		 473 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  30.36 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  30.56 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  31.44 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  30.62 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  33.5 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  30.6 
 
 		 454 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  33.56 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  27.17 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.9 
 
 		 446 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  28.48 
 
 		 463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  32.85 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.54 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  33.78 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  33.24 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  30.42 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  31.06 
 
 		 460 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  30.85 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.27 
 
 		 1365 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  31.11 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.07 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.37 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  30.05 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  30.15 
 
 		 457 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.53 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  28.61 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  32.31 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  29.56 
 
 		 1373 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  29.56 
 
 		 1373 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  29.56 
 
 		 1373 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  29.56 
 
 		 1373 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  29.56 
 
 		 1373 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  29.56 
 
 		 1373 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  29.31 
 
 		 1373 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  30.87 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  28.38 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.3 
 
 		 452 aa  156  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  28.67 
 
 		 1380 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  28.97 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  28.67 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  27.72 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  29.02 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  29.02 
 
 		 474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  29.02 
 
 		 453 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  26.86 
 
 		 469 aa  147  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  28.68 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  29.58 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  28.4 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  29.21 
 
 		 525 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  32.75 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  30.3 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  28.94 
 
 		 546 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  28.61 
 
 		 473 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  27.09 
 
 		 454 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  31.44 
 
 		 465 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  32.16 
 
 		 508 aa  140  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  25 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>