More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2337 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  100 
 
 		 458 aa  917    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  64.67 
 
 		 452 aa  569  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  66.07 
 
 		 449 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  57.17 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  40.92 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  31.93 
 
 		 453 aa  272  8.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  33.92 
 
 		 457 aa  271  1e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  32.37 
 
 		 453 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  32.15 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  35.49 
 
 		 463 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  33.69 
 
 		 462 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  33.63 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  34.21 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  34.73 
 
 		 464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  30.52 
 
 		 468 aa  213  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  33.85 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  33.85 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  30.44 
 
 		 441 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  33.41 
 
 		 467 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  33.41 
 
 		 461 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  30.45 
 
 		 484 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  35.58 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.24 
 
 		 459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  33.25 
 
 		 465 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  34.04 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  32.95 
 
 		 463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  30.45 
 
 		 482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  31.29 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  29.98 
 
 		 464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  32.89 
 
 		 462 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  31.87 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  31.92 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  31.79 
 
 		 470 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.88 
 
 		 453 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  32.31 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  29.95 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  32.8 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  30 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  33.33 
 
 		 462 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.56 
 
 		 432 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  32.57 
 
 		 459 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  30.82 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  33.84 
 
 		 452 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  32.01 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  31.13 
 
 		 455 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  32.75 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  29.41 
 
 		 466 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  31.76 
 
 		 433 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  31.58 
 
 		 431 aa  177  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  30.32 
 
 		 470 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  31.62 
 
 		 454 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29 
 
 		 446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  29.18 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  31.53 
 
 		 445 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  27.23 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  32.72 
 
 		 473 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  31.92 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  31.11 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  29.8 
 
 		 1373 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  32.43 
 
 		 489 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.1 
 
 		 1365 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  32.38 
 
 		 445 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  32.02 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  28.57 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  29.56 
 
 		 1373 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  32.81 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  29.13 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  30.34 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  28.05 
 
 		 461 aa  159  8e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  33.42 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  29.31 
 
 		 1373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  29.31 
 
 		 1373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  29.31 
 
 		 1373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  28.05 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  29.31 
 
 		 1373 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  29.31 
 
 		 1373 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  28.33 
 
 		 1380 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  27.86 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  30.54 
 
 		 525 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30.89 
 
 		 452 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  30.17 
 
 		 474 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  30.17 
 
 		 474 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  29.93 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  29.5 
 
 		 460 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  29.6 
 
 		 461 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  31.62 
 
 		 429 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  26.52 
 
 		 448 aa  149  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  30.81 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  27.9 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  31.37 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.09 
 
 		 452 aa  146  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.13 
 
 		 549 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  32.35 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  28.8 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  30.69 
 
 		 1055 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  31.35 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29.43 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  26.54 
 
 		 644 aa  141  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  25.74 
 
 		 769 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  26.81 
 
 		 563 aa  140  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>