More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3985 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  93.79 
 
 
470 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  100 
 
 
466 aa  954    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  70.75 
 
 
466 aa  693    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  63.2 
 
 
462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  59.78 
 
 
464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  41.09 
 
 
464 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  41 
 
 
470 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  39.35 
 
 
462 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  40.91 
 
 
463 aa  322  8e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  37.17 
 
 
467 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  39.86 
 
 
465 aa  312  1e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  37.44 
 
 
466 aa  312  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  37.22 
 
 
466 aa  310  4e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  37.07 
 
 
480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  36.73 
 
 
463 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  37.88 
 
 
460 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  36.8 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  35.47 
 
 
461 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  36.18 
 
 
462 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  34.08 
 
 
459 aa  247  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  35.19 
 
 
462 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  33.55 
 
 
471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.07 
 
 
471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  33.78 
 
 
473 aa  232  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  35.12 
 
 
462 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.47 
 
 
453 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  35 
 
 
452 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  31.26 
 
 
458 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  34.69 
 
 
478 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.3 
 
 
468 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  34.67 
 
 
459 aa  219  7e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  34.22 
 
 
459 aa  219  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  31.91 
 
 
470 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  29.87 
 
 
484 aa  211  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  32.22 
 
 
457 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  30.95 
 
 
482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  30.66 
 
 
452 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  29.85 
 
 
454 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.93 
 
 
446 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.88 
 
 
466 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.29 
 
 
447 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  31.07 
 
 
450 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  33.01 
 
 
452 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.12 
 
 
459 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  30.94 
 
 
452 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  30.11 
 
 
455 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  27.71 
 
 
462 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  29.41 
 
 
458 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.81 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  32.88 
 
 
455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.03 
 
 
439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.88 
 
 
432 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.73 
 
 
441 aa  173  5.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  28.22 
 
 
433 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  28.33 
 
 
453 aa  172  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  27.92 
 
 
457 aa  171  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.61 
 
 
445 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.33 
 
 
453 aa  170  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  29.14 
 
 
445 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  30.88 
 
 
449 aa  169  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.11 
 
 
453 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  29.48 
 
 
508 aa  168  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  29.54 
 
 
460 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  29.93 
 
 
452 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  29.19 
 
 
444 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  29.57 
 
 
452 aa  166  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  29.24 
 
 
429 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  28.88 
 
 
489 aa  166  9e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.64 
 
 
431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.02 
 
 
445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  27.29 
 
 
463 aa  163  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.77 
 
 
446 aa  163  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  27.5 
 
 
448 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  27.59 
 
 
437 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  29.01 
 
 
454 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  27.29 
 
 
469 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  25.81 
 
 
451 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  28.1 
 
 
453 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  28.37 
 
 
1365 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  28.3 
 
 
1380 aa  154  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  28.33 
 
 
1373 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  27.58 
 
 
546 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  28.57 
 
 
474 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  28.57 
 
 
474 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  28.1 
 
 
1373 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  28.1 
 
 
1373 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  29.09 
 
 
449 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  28.1 
 
 
1373 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  28.1 
 
 
1373 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  27.64 
 
 
525 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  28.1 
 
 
1373 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  28.1 
 
 
1373 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  28.57 
 
 
453 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  26.93 
 
 
430 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  26.2 
 
 
447 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  29.59 
 
 
452 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  27.1 
 
 
473 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  28.01 
 
 
769 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  29.1 
 
 
461 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  30.08 
 
 
1055 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>