More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4559 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  100 
 
 		 463 aa  957    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  43.83 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  41.98 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  41.45 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  41.54 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  40.48 
 
 		 457 aa  348  8e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  36.18 
 
 		 452 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  35.86 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  36.61 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  36.36 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  32.7 
 
 		 462 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.69 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  30.98 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  32.05 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  31.52 
 
 		 466 aa  199  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  31.68 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  31.3 
 
 		 466 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  31.37 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  31.39 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  33.08 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  31.18 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  31.24 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  29.69 
 
 		 460 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  31.89 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  31.28 
 
 		 465 aa  186  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  30.16 
 
 		 484 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.95 
 
 		 441 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  27.49 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  27.83 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  29.19 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  31.2 
 
 		 463 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  30.31 
 
 		 459 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  31.53 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  32.26 
 
 		 459 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  30.03 
 
 		 446 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.19 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  28.2 
 
 		 466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  28.11 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  30.26 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  30.26 
 
 		 460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  27.29 
 
 		 466 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.61 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  31.54 
 
 		 453 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  30.71 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  26.52 
 
 		 470 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  30.09 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  29.85 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  28.96 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  29.41 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  30.61 
 
 		 450 aa  157  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.81 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  33.51 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  35.53 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  29.09 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.21 
 
 		 454 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  28.89 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.81 
 
 		 466 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  29.44 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  27.22 
 
 		 482 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  28.46 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  27.85 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  30.05 
 
 		 437 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  27.22 
 
 		 455 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  29.56 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  29.46 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  27.1 
 
 		 445 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  26.3 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  28.57 
 
 		 457 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  30.83 
 
 		 489 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.18 
 
 		 432 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  27.98 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  27.1 
 
 		 492 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  26.7 
 
 		 454 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  27.1 
 
 		 492 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  27.55 
 
 		 1055 aa  136  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  30.12 
 
 		 1079 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  30.12 
 
 		 1079 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  28.95 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  28.21 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  27.29 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  26.86 
 
 		 1365 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.18 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  26.09 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  27.89 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  27.61 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  28.78 
 
 		 444 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  27.74 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.36 
 
 		 1373 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  24.26 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  24.26 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.12 
 
 		 1373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.12 
 
 		 1380 aa  127  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  25.36 
 
 		 1373 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.36 
 
 		 1373 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.36 
 
 		 1373 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  27.13 
 
 		 452 aa  126  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.36 
 
 		 1373 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.36 
 
 		 1373 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  25.56 
 
 		 459 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  26.54 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>