More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3868 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  100 
 
 		 473 aa  952    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  67.84 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  70.35 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  61.86 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  34.42 
 
 		 459 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  32.44 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  31.62 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  30.05 
 
 		 448 aa  189  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  31.01 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  31.79 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  32.82 
 
 		 431 aa  186  9e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  31.51 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  31.45 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  31.9 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  31.9 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  31.58 
 
 		 452 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.89 
 
 		 445 aa  180  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  30.38 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  30.84 
 
 		 1373 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  30.84 
 
 		 1373 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  30.84 
 
 		 1373 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  30.95 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  30.62 
 
 		 1373 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  30.62 
 
 		 1380 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  34.57 
 
 		 462 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  29.62 
 
 		 452 aa  171  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  30.55 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  29.71 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  31.79 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  33.5 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  30.02 
 
 		 461 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29 
 
 		 457 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.56 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  27.56 
 
 		 458 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  30.6 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  30.09 
 
 		 1365 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  32.68 
 
 		 478 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  25.44 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.66 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  30.49 
 
 		 462 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.55 
 
 		 453 aa  159  9e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  30.65 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  25.96 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  30.41 
 
 		 462 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  32.86 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  31.47 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  32.36 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  27.64 
 
 		 462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  25.33 
 
 		 453 aa  156  7e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  31.34 
 
 		 489 aa  156  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  27.35 
 
 		 466 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  31.27 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  28.4 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  28.4 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  34.16 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  29.36 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  30.37 
 
 		 470 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  33.67 
 
 		 455 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  28.8 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  29.45 
 
 		 461 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.07 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  27.92 
 
 		 455 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  31.54 
 
 		 395 aa  151  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  32.24 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  31.78 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  29.64 
 
 		 462 aa  150  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  27.68 
 
 		 560 aa  150  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  25 
 
 		 459 aa  150  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  29.21 
 
 		 487 aa  149  8e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  31.67 
 
 		 467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  27.23 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29.89 
 
 		 474 aa  148  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  33.56 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  30.45 
 
 		 466 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  31.53 
 
 		 464 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  30.47 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  29.61 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  28.8 
 
 		 463 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  28.07 
 
 		 508 aa  144  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  26.94 
 
 		 546 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  27.1 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.72 
 
 		 479 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  30.02 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  27.23 
 
 		 462 aa  143  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  31.26 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  29.93 
 
 		 599 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  31.86 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  30.05 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  31.06 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  31.54 
 
 		 1096 aa  140  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  25.49 
 
 		 457 aa  140  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  33.16 
 
 		 463 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  26.11 
 
 		 1053 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  32.12 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  28.53 
 
 		 1055 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  29.8 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  29.8 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>