More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3643 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  100 
 
 		 444 aa  878    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  61.86 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  64.87 
 
 		 432 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  59.25 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.06 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  33.64 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.64 
 
 		 452 aa  189  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.02 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.54 
 
 		 459 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  31.21 
 
 		 482 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  30.54 
 
 		 455 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.16 
 
 		 454 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  32.88 
 
 		 445 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  30.07 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.28 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  29.53 
 
 		 462 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  28.9 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  29.57 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  30.25 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29.69 
 
 		 457 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  30.99 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  28.7 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  32.68 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  29.83 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  29.96 
 
 		 1380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  31.35 
 
 		 478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27.63 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  29.74 
 
 		 1373 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  29.74 
 
 		 1373 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  29.74 
 
 		 1373 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  29.74 
 
 		 1373 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  29.74 
 
 		 1373 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  29.74 
 
 		 1373 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  29.52 
 
 		 1373 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  26.3 
 
 		 495 aa  162  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  32.21 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  28.68 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  26.93 
 
 		 461 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  27.95 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  28.64 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  29.98 
 
 		 508 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.67 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  25.67 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  32.2 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  30.99 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  25.37 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  28.99 
 
 		 446 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  31.63 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  29.77 
 
 		 452 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  28.31 
 
 		 445 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  28.06 
 
 		 454 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  31.16 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  28.86 
 
 		 1365 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.4 
 
 		 458 aa  150  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  28.61 
 
 		 462 aa  150  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  32.22 
 
 		 459 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.49 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  24.87 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  29.93 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  33.09 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  30.79 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  27.64 
 
 		 460 aa  147  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  34.65 
 
 		 473 aa  147  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  26.57 
 
 		 457 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  28.78 
 
 		 439 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  27.63 
 
 		 464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  30.34 
 
 		 467 aa  146  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  32.68 
 
 		 455 aa  146  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  32.61 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  28.05 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  30.88 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  30.27 
 
 		 466 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  27.08 
 
 		 447 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  30.04 
 
 		 489 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  29.2 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  30.02 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  27 
 
 		 546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  30.24 
 
 		 487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  31.46 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  29.48 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  25 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  28.81 
 
 		 448 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  25.78 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  26.19 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.56 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  27.91 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  26.6 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  31.69 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  26.74 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  25.35 
 
 		 466 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  25.5 
 
 		 644 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  28.1 
 
 		 449 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  28.54 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  26.12 
 
 		 525 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  28.77 
 
 		 455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  24.2 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  25.55 
 
 		 484 aa  133  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  25.64 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  27.23 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  24.52 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>