More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0853 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  100 
 
 		 459 aa  943    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  88.89 
 
 		 459 aa  849    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  76.81 
 
 		 460 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  88.89 
 
 		 459 aa  848    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  73.3 
 
 		 453 aa  694    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  56.01 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  53 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  41.96 
 
 		 448 aa  345  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  41.96 
 
 		 441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  40.5 
 
 		 480 aa  322  8e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  37.9 
 
 		 480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  37.9 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  37.9 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  37.92 
 
 		 493 aa  302  9e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  37.89 
 
 		 482 aa  299  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  36.22 
 
 		 497 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  36.22 
 
 		 497 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  37.56 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  35.92 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  37.99 
 
 		 451 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  38.19 
 
 		 492 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  36.12 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  36.12 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  36.12 
 
 		 485 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  31.35 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  29.95 
 
 		 470 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  30.34 
 
 		 443 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  31.37 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  30 
 
 		 475 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  28.88 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  26.46 
 
 		 448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.79 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  29.02 
 
 		 473 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.57 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  30.4 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  26.64 
 
 		 551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  28.67 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.19 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  29.33 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.5 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  26.38 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  25.11 
 
 		 448 aa  140  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  30.59 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  27.35 
 
 		 1373 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  27.13 
 
 		 1373 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  27.13 
 
 		 1373 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  27.13 
 
 		 1373 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  27.13 
 
 		 1373 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  27.35 
 
 		 1380 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  29.57 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  27.13 
 
 		 1373 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  27.13 
 
 		 1373 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26.06 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  26.16 
 
 		 1365 aa  137  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  25.6 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  28.15 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  28.09 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  23.95 
 
 		 459 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.17 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  26.48 
 
 		 484 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  27.44 
 
 		 471 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  26.3 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.54 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  25.06 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  25.06 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  36.36 
 
 		 252 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  25.49 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.54 
 
 		 439 aa  130  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  25.5 
 
 		 452 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  24.29 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.1 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  26.74 
 
 		 473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  26.87 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  26.9 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  27.56 
 
 		 452 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  26.42 
 
 		 457 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.19 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  27.91 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  28.16 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03561  cytochrome P450 enzyme  25.36 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.726457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  26.85 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  29.46 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  25.18 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  25.18 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  25.18 
 
 		 451 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  27.16 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  28.05 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  29.22 
 
 		 450 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  27.66 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3498  cytochrome P450  26.92 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.340562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  25.83 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  27.66 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  28.12 
 
 		 462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  28.41 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  24.17 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  27.94 
 
 		 461 aa  120  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  28.42 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  28.42 
 
 		 450 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  27.87 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  25.93 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>