More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4605 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  100 
 
 
469 aa  926    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  41.16 
 
 
448 aa  339  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  39.17 
 
 
480 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  38.85 
 
 
497 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  38.85 
 
 
497 aa  299  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  39.78 
 
 
485 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  39.78 
 
 
485 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  39.78 
 
 
485 aa  292  9e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  36.91 
 
 
493 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  36.56 
 
 
480 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  36.56 
 
 
480 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  36.56 
 
 
480 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  38.81 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  37.75 
 
 
446 aa  274  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  37.36 
 
 
493 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  38.57 
 
 
492 aa  264  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  35.02 
 
 
482 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  38.75 
 
 
451 aa  256  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  34.26 
 
 
469 aa  243  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  31.35 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  30.61 
 
 
459 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  30.23 
 
 
459 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  30.67 
 
 
453 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  30.95 
 
 
464 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  28.18 
 
 
460 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  45.9 
 
 
252 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  27.27 
 
 
459 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  26.12 
 
 
470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  30.16 
 
 
475 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  25.06 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  31.11 
 
 
441 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  21.45 
 
 
448 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.66 
 
 
447 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  27.17 
 
 
551 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  29.61 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  28.42 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  28.71 
 
 
484 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  24.81 
 
 
452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  25.31 
 
 
452 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  26.75 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26.76 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  24.57 
 
 
448 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  30.38 
 
 
429 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  27.32 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  31.35 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  31.35 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  29.6 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  25.12 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  25.12 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  25.12 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.17 
 
 
466 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  25.71 
 
 
473 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  25.67 
 
 
432 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  31.35 
 
 
453 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.14 
 
 
482 aa  110  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  29.86 
 
 
445 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27.06 
 
 
1365 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  23.31 
 
 
455 aa  106  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  26.08 
 
 
451 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  29.02 
 
 
457 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  24.34 
 
 
473 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  24.82 
 
 
459 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  24.34 
 
 
473 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  29.34 
 
 
447 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  29.34 
 
 
447 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  27.44 
 
 
476 aa  104  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  29.08 
 
 
447 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  28.03 
 
 
430 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3498  cytochrome P450  28.64 
 
 
450 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.340562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  30.45 
 
 
452 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  23.32 
 
 
462 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  27.81 
 
 
452 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.02 
 
 
444 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  24.28 
 
 
460 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  29.94 
 
 
452 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  25.06 
 
 
1075 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  26.94 
 
 
489 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  24.56 
 
 
468 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  23.39 
 
 
451 aa  100  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  23.87 
 
 
492 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  23.87 
 
 
492 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  24.81 
 
 
429 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  29.73 
 
 
455 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  25.37 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  22.93 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  24.73 
 
 
467 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  23.54 
 
 
1053 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2227  cytochrome P450  38.18 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.536845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  25.88 
 
 
440 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  30.16 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  26.81 
 
 
1373 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  35.67 
 
 
453 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.57 
 
 
1373 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  28.57 
 
 
471 aa  96.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  25.42 
 
 
439 aa  96.7  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  22.87 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.81 
 
 
1380 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  22.28 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  21.69 
 
 
446 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  27.73 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>