More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3794 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  100 
 
 		 446 aa  927    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  57.79 
 
 		 448 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  47.52 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  48.67 
 
 		 441 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  49.18 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  45.39 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  45.39 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  45.39 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  44.91 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  44.91 
 
 		 497 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  44.74 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  45.96 
 
 		 493 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  42.6 
 
 		 482 aa  349  7e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  41.31 
 
 		 480 aa  346  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  41.08 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  41.08 
 
 		 480 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  44.84 
 
 		 492 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  37.92 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  36.94 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  37.56 
 
 		 459 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  38.55 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  36.26 
 
 		 453 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  35.73 
 
 		 469 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  36.65 
 
 		 459 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  37.08 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  52.17 
 
 		 252 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  31.95 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  28.04 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  29.23 
 
 		 551 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  28.64 
 
 		 470 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  25.71 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  25.71 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  31.99 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  31.99 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  26.98 
 
 		 452 aa  153  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.47 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  30.38 
 
 		 453 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  26.35 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  25.12 
 
 		 448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  27.21 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  28.18 
 
 		 479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26.73 
 
 		 454 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  28.11 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  26.45 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  26.45 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  26.45 
 
 		 451 aa  143  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  29.13 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  27.27 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  26.25 
 
 		 429 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  26.62 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  28.2 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  25.72 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  30.58 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  25 
 
 		 473 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  27 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  26.28 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.06 
 
 		 446 aa  133  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30.64 
 
 		 452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  28.96 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  28 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  28 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  24.35 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  25.65 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  26.13 
 
 		 471 aa  129  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  27.38 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  26.08 
 
 		 451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  26.19 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  28.86 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  28.2 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  26.55 
 
 		 450 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  25.06 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  26.26 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  24.62 
 
 		 525 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  24.82 
 
 		 455 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  28.74 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  25.12 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  27.05 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  24.48 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  24.94 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  24.82 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  28.7 
 
 		 462 aa  123  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  24.48 
 
 		 453 aa  123  8e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  24.24 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  25.76 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  26.46 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  25.59 
 
 		 440 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  27.23 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27.23 
 
 		 1365 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  28.24 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  26.3 
 
 		 465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  25.23 
 
 		 462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.28 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  23.95 
 
 		 463 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  24.15 
 
 		 462 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  24.88 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  28.66 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  25.45 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  29.61 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  24.94 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  23.4 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>