More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4693 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  74.72 
 
 		 453 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  76.37 
 
 		 459 aa  739    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  100 
 
 		 460 aa  940    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  77.46 
 
 		 459 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  76.81 
 
 		 459 aa  745    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  56.75 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  55.53 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  42.02 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  41.41 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  39.82 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  39.91 
 
 		 482 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  39.46 
 
 		 480 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  39.46 
 
 		 480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  39.46 
 
 		 480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  36.89 
 
 		 497 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  36.89 
 
 		 497 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  37.28 
 
 		 493 aa  299  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  35.71 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  36.94 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  38.8 
 
 		 451 aa  289  8e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  37.42 
 
 		 485 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  37.42 
 
 		 485 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  37.42 
 
 		 485 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  36.87 
 
 		 492 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  31.03 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  30.09 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.07 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  30.32 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  25.81 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  28.18 
 
 		 469 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.61 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  27.06 
 
 		 429 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  29.5 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  28.09 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  30.79 
 
 		 328 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  27.46 
 
 		 454 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  29.24 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  27.48 
 
 		 551 aa  150  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  29.8 
 
 		 479 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  30.27 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  27.94 
 
 		 482 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  28.44 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  26.62 
 
 		 1365 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  29.17 
 
 		 459 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.5 
 
 		 447 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.02 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  30.39 
 
 		 457 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  27.41 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  26 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  28.74 
 
 		 463 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  25.3 
 
 		 432 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  26.21 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  28.43 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  37.57 
 
 		 252 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  25.8 
 
 		 455 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  27.4 
 
 		 471 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  33.06 
 
 		 455 aa  132  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  28.37 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.01 
 
 		 1380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  27.17 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  26.17 
 
 		 1373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.76 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.95 
 
 		 1373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 		 1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 		 1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.95 
 
 		 1373 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 		 1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.4 
 
 		 1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  27.78 
 
 		 458 aa  129  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27.3 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  25.11 
 
 		 448 aa  127  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  26.81 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  29.43 
 
 		 452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  30.77 
 
 		 489 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  29.55 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  26.86 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  28.03 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.19 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  26.47 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  25 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  24.75 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03561  cytochrome P450 enzyme  25.99 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.726457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  25.17 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  27.44 
 
 		 430 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  25.17 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  26.28 
 
 		 467 aa  123  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  26.23 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  24.75 
 
 		 454 aa  123  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  29.16 
 
 		 460 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  26.62 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  24.94 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  24.94 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  24.94 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  27.49 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  28.05 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  25.52 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  25.44 
 
 		 452 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  25.53 
 
 		 471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  27.85 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  26.46 
 
 		 464 aa  120  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>