More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3337 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  100 
 
 
464 aa  942    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  64.4 
 
 
469 aa  586  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  56.59 
 
 
453 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  55.53 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  54.61 
 
 
459 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  53 
 
 
459 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  53.92 
 
 
459 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  42.52 
 
 
441 aa  325  7e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  38.5 
 
 
448 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  39.82 
 
 
480 aa  302  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  38.55 
 
 
446 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  40.18 
 
 
482 aa  293  5e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  38.28 
 
 
451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  39.45 
 
 
485 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  39.45 
 
 
485 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  39.45 
 
 
485 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  37.73 
 
 
480 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  37.73 
 
 
480 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  37.73 
 
 
480 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  35.37 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  35.37 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  37.1 
 
 
493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  36.65 
 
 
493 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  35.83 
 
 
492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  30.75 
 
 
470 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  31.51 
 
 
443 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  30.95 
 
 
469 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  32.48 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  32.13 
 
 
328 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  29.06 
 
 
432 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  33.12 
 
 
474 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  33.12 
 
 
474 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.05 
 
 
459 aa  167  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  32.81 
 
 
453 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  31.35 
 
 
479 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28 
 
 
447 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  32.96 
 
 
452 aa  160  5e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  29.29 
 
 
551 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  29.14 
 
 
482 aa  158  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  22.69 
 
 
448 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  32.23 
 
 
482 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.95 
 
 
445 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  26.73 
 
 
429 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.33 
 
 
453 aa  153  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  27.76 
 
 
463 aa  153  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  26.64 
 
 
473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  26.96 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.05 
 
 
446 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  26.55 
 
 
451 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  26.55 
 
 
451 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  26.55 
 
 
451 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  41.71 
 
 
252 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  26.47 
 
 
452 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26.14 
 
 
454 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  28.2 
 
 
444 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  28.16 
 
 
457 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  27.74 
 
 
466 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  26.18 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  26.38 
 
 
446 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  23.11 
 
 
459 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  28.88 
 
 
453 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30.96 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  28.96 
 
 
1365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  26.6 
 
 
484 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.51 
 
 
445 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.08 
 
 
439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  30.94 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.28 
 
 
447 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  28.38 
 
 
473 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  26.71 
 
 
451 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  28.97 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  31.02 
 
 
461 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  26.6 
 
 
489 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  26.05 
 
 
451 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  32.77 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  25.55 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  37.62 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  34.5 
 
 
452 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  25.33 
 
 
459 aa  126  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  27.76 
 
 
471 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  29.63 
 
 
1064 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  26.33 
 
 
459 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  28.95 
 
 
441 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.68 
 
 
458 aa  123  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  26.51 
 
 
470 aa  123  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  25.53 
 
 
457 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  30.52 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.27 
 
 
1380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  24.76 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  27.51 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  29.01 
 
 
450 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  29.01 
 
 
450 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.05 
 
 
1373 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  25 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  24.84 
 
 
1373 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.05 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.05 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  25.39 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.05 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.05 
 
 
1373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>