More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3188 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  100 
 
 
485 aa  995    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  100 
 
 
485 aa  995    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  100 
 
 
485 aa  995    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  50.11 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  47.29 
 
 
493 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  46.06 
 
 
497 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  46.06 
 
 
497 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  46.57 
 
 
493 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  46.19 
 
 
480 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  45.39 
 
 
446 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  49.19 
 
 
451 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  45.02 
 
 
441 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  46.58 
 
 
492 aa  385  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  42.92 
 
 
482 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  41.65 
 
 
480 aa  356  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  41.43 
 
 
480 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  41.43 
 
 
480 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  38.74 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  36.11 
 
 
469 aa  301  2e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  37.67 
 
 
459 aa  299  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  37.55 
 
 
460 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  39.45 
 
 
464 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  36.12 
 
 
459 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  37.98 
 
 
459 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  39.55 
 
 
469 aa  290  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  70.27 
 
 
252 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  28.6 
 
 
443 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  27.88 
 
 
470 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  27.33 
 
 
475 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.11 
 
 
447 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  26.67 
 
 
551 aa  152  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  24.64 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  28.51 
 
 
445 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  22.95 
 
 
448 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  26.02 
 
 
459 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  27.21 
 
 
473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  26.63 
 
 
439 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  27.62 
 
 
452 aa  137  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  28.49 
 
 
453 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  28.22 
 
 
474 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  28.22 
 
 
474 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  25.39 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  24.47 
 
 
429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  24.24 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  25.06 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  26.97 
 
 
328 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  25.38 
 
 
452 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  26.39 
 
 
445 aa  133  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  25.69 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  28.83 
 
 
479 aa  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  24.43 
 
 
492 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  24.22 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  24.45 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  26.96 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  24.45 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  24.45 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.91 
 
 
447 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  24.21 
 
 
492 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  26.27 
 
 
463 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  37.3 
 
 
453 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  24.41 
 
 
473 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  29.87 
 
 
457 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  25 
 
 
451 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  24.31 
 
 
431 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  22.22 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  25.06 
 
 
482 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  22.03 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  27.93 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  26.18 
 
 
451 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  24.41 
 
 
440 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  26.04 
 
 
465 aa  120  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  23.56 
 
 
448 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  26.5 
 
 
462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  24.36 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  24.21 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  25.66 
 
 
445 aa  118  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  27.08 
 
 
459 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  30.11 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  29.75 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  25 
 
 
471 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  25 
 
 
482 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  23.68 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  23.67 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  21.76 
 
 
455 aa  114  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  24.94 
 
 
466 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  28.44 
 
 
453 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  23.42 
 
 
444 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  23.54 
 
 
441 aa  113  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  22.28 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  25.46 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  27.8 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  24.65 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  23.41 
 
 
455 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  30.23 
 
 
1064 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  29.82 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00300  sterol 14-demethylase, putative  23.89 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  23.64 
 
 
448 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  31.06 
 
 
1053 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  27.46 
 
 
470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  25.45 
 
 
460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>