More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2664 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  100 
 
 		 441 aa  892    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  56.12 
 
 		 448 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  49.77 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  52.68 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  47.45 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  45.06 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  45.35 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  45.35 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  45.06 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  45.35 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  43.32 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  43.32 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  43.09 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  42.4 
 
 		 482 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  42.63 
 
 		 493 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  42.26 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  42.44 
 
 		 453 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  42.3 
 
 		 493 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  42.56 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  42.37 
 
 		 459 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  42.89 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  41.69 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  42.14 
 
 		 459 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  43.22 
 
 		 492 aa  325  9e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  38.62 
 
 		 469 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  35.55 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  28.96 
 
 		 443 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  50.54 
 
 		 252 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  28.51 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  32.71 
 
 		 479 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  30.86 
 
 		 551 aa  172  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.6 
 
 		 447 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  29.71 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  29.12 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.95 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  30.66 
 
 		 446 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  23.38 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  29.52 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  29.29 
 
 		 441 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.44 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  26.29 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  27.25 
 
 		 452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  26.62 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  26.56 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  26.56 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  27.52 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  28.94 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  27.95 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.1 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  27.86 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  27.68 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  27.68 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  27.68 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  29.04 
 
 		 489 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  24.16 
 
 		 462 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  27.6 
 
 		 473 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.5 
 
 		 453 aa  133  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  27.64 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  28.09 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  24.82 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  29.97 
 
 		 450 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  30.38 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  30.38 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30 
 
 		 452 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  25.89 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  22.54 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  30.38 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  28.57 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  28.57 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  27.39 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  25.06 
 
 		 471 aa  127  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  28.93 
 
 		 1365 aa  127  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  26.88 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  23.25 
 
 		 455 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  27.83 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  25.6 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.78 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  25.6 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  24.78 
 
 		 448 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  24.28 
 
 		 454 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  24.28 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  25.93 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  25.39 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  26.65 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  27.21 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  22.35 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  28.97 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  25.82 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  22.35 
 
 		 447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  26.14 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  28 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  24.48 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  24.19 
 
 		 455 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  26.65 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  25.78 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  26.42 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  26.58 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  25.4 
 
 		 444 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  26.79 
 
 		 451 aa  116  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  22.57 
 
 		 457 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>