More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3562 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  100 
 
 		 451 aa  929    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  52.31 
 
 		 448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  52.72 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  47.1 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  49.18 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  49.19 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  49.19 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  49.19 
 
 		 485 aa  393  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  46.3 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  46.3 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  45.85 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  44.68 
 
 		 493 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  44.78 
 
 		 482 aa  349  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  43.29 
 
 		 492 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  41.72 
 
 		 469 aa  332  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  41.07 
 
 		 480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  40.84 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  40.84 
 
 		 480 aa  326  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  37.67 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  37.99 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  38.71 
 
 		 460 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  39.16 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  38.28 
 
 		 464 aa  292  9e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  37.47 
 
 		 459 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  38.52 
 
 		 469 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  52.2 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  31.68 
 
 		 475 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  27.42 
 
 		 443 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  28.92 
 
 		 551 aa  166  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.08 
 
 		 452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.1 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.71 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.38 
 
 		 459 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  29.2 
 
 		 445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  24.29 
 
 		 459 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  26.76 
 
 		 470 aa  143  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.16 
 
 		 439 aa  140  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  27.56 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.42 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  26.43 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  25.42 
 
 		 473 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  28.9 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  26.6 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  25.25 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  22.85 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  26.14 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  26.13 
 
 		 328 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  30.68 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  26.04 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  26.04 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  28.54 
 
 		 484 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  29.61 
 
 		 474 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  27.03 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  29.61 
 
 		 474 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  27.03 
 
 		 451 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  27.03 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  28.12 
 
 		 463 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  27.99 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  23.39 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  23.39 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  25.55 
 
 		 467 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  26.5 
 
 		 459 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  27.51 
 
 		 471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  26.57 
 
 		 457 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  27.51 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10779  cytochrome P450 51 cyp51  25.52 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  26.67 
 
 		 453 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  26.7 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  39.23 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3843  cytochrome P450  25.17 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  26.67 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  26.83 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  26.43 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  24.34 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  23.02 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  25.67 
 
 		 444 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  25.81 
 
 		 448 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.27 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  25.27 
 
 		 453 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.58 
 
 		 1373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  28 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  26.54 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  28.76 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.58 
 
 		 1373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63421  Cytochrome P450 51 (CYPLI) (P450-LIA1) (Sterol 14-alpha demethylase) (Lanosterol 14-alpha demethylase) (P450-14DM)  23.09 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.195375  normal  0.579386 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.98 
 
 		 1373 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  26.09 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  27.29 
 
 		 479 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  23.86 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.98 
 
 		 1373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.98 
 
 		 1373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.98 
 
 		 1373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  25.98 
 
 		 1373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.35 
 
 		 1380 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  25 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  21.55 
 
 		 447 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  23.91 
 
 		 440 aa  113  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  26.4 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  26.65 
 
 		 463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>