More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0772 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  73.66 
 
 		 453 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  91.72 
 
 		 459 aa  874    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  77.46 
 
 		 460 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  100 
 
 		 459 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  88.89 
 
 		 459 aa  848    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  55.56 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  54.61 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  42.12 
 
 		 448 aa  353  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  42.06 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  40.91 
 
 		 480 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  39.56 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  39.56 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  39.56 
 
 		 480 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  38.56 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  36.6 
 
 		 493 aa  299  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  38.51 
 
 		 482 aa  299  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  37.92 
 
 		 446 aa  297  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  36.16 
 
 		 497 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  36.16 
 
 		 497 aa  295  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  37.67 
 
 		 451 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  37.67 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  37.67 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  37.67 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  37.03 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  31.11 
 
 		 443 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  30.25 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  30.61 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  27.29 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  29.87 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  29.5 
 
 		 475 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  27.78 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.35 
 
 		 459 aa  161  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  30.09 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.96 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  29.13 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  26.73 
 
 		 551 aa  154  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  27.99 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  27.34 
 
 		 463 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.88 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  30.88 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.1 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.51 
 
 		 432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.39 
 
 		 447 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26.01 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.4 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  37.43 
 
 		 252 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.32 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  27.32 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  25.86 
 
 		 1365 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  23.19 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  27.9 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  26.77 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  30.73 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.48 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.68 
 
 		 1373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  27.04 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  25.68 
 
 		 1380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  27.94 
 
 		 459 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  32.81 
 
 		 455 aa  130  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  26.81 
 
 		 471 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  26.35 
 
 		 1373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  26.35 
 
 		 1373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  26.35 
 
 		 1373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  27.14 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  26.35 
 
 		 1373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.45 
 
 		 1373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3498  cytochrome P450  28.35 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.340562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  27.99 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  26.35 
 
 		 1373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  26.49 
 
 		 454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  26.06 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  28.95 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  27.75 
 
 		 462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  23.49 
 
 		 448 aa  126  9e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  28.14 
 
 		 466 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  27.54 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  26.78 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03561  cytochrome P450 enzyme  25.61 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.726457 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  26.35 
 
 		 465 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  29.81 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  25.55 
 
 		 452 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  25.74 
 
 		 457 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  23.19 
 
 		 459 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  29.1 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  26.99 
 
 		 463 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  26.92 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  28.24 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  27.87 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  26.23 
 
 		 460 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  27.06 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  26.21 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  26.21 
 
 		 451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  27.87 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  24.19 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  26.55 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  27.6 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  26.21 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  27.87 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  27.72 
 
 		 461 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  24.88 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>