More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4102 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  100 
 
 		 452 aa  892    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  69.63 
 
 		 482 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  66.82 
 
 		 452 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  64.81 
 
 		 455 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  63.27 
 
 		 452 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  37.59 
 
 		 444 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  34.38 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  38.34 
 
 		 447 aa  273  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  37.7 
 
 		 1365 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  34.23 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  33.71 
 
 		 457 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  36.62 
 
 		 454 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  34.16 
 
 		 1380 aa  263  6e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  34.16 
 
 		 1373 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  34.16 
 
 		 1373 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  34.16 
 
 		 1373 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  34.16 
 
 		 1373 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  34.16 
 
 		 1373 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  34.16 
 
 		 1373 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  34.16 
 
 		 1373 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  35.39 
 
 		 460 aa  255  9e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  38.48 
 
 		 445 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  32.96 
 
 		 447 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  33.33 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  39 
 
 		 445 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  34.74 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  33.74 
 
 		 459 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  33.56 
 
 		 484 aa  236  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  30.89 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  31.64 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  37.92 
 
 		 489 aa  232  8.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  30.93 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  35.65 
 
 		 468 aa  230  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  37.33 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  34.91 
 
 		 433 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  36.91 
 
 		 451 aa  229  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  40.96 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  35.25 
 
 		 431 aa  227  4e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  36.55 
 
 		 437 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  34.15 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  38.46 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  36.39 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  35.01 
 
 		 480 aa  219  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  37.03 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  33.96 
 
 		 469 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  35.55 
 
 		 459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  34.18 
 
 		 461 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  35.17 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  34.48 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  32.89 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.48 
 
 		 471 aa  209  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  38.29 
 
 		 464 aa  209  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  35.9 
 
 		 465 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.84 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  34.65 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  32.31 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  30.3 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  35.54 
 
 		 458 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  38.42 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  34.4 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  31.44 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  38.18 
 
 		 466 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  31.44 
 
 		 495 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  35.98 
 
 		 462 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  38.18 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  33.65 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  37.01 
 
 		 460 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  30.72 
 
 		 644 aa  199  9e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  36.05 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  32.6 
 
 		 474 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  37.28 
 
 		 473 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  37.14 
 
 		 463 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  37.17 
 
 		 459 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  36.91 
 
 		 459 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  33.58 
 
 		 464 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  37.16 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  38.2 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  34.03 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  36.55 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  32.84 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  33.01 
 
 		 466 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  33.5 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  33.95 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  30.35 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  26.27 
 
 		 453 aa  186  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  26.27 
 
 		 453 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  32.21 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  33.67 
 
 		 479 aa  186  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  26.27 
 
 		 453 aa  186  8e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  28.97 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  32.83 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  31 
 
 		 769 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  31.61 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  31.58 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  36.48 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  34.83 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  28.57 
 
 		 560 aa  180  4.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  34.26 
 
 		 462 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  34.02 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  32.01 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>