More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2503 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  100 
 
 		 480 aa  987    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  56.56 
 
 		 482 aa  536  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  56.28 
 
 		 480 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  56.06 
 
 		 480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  56.06 
 
 		 480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  54.04 
 
 		 448 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  49.41 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  47.52 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  45.19 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  45.19 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  46.19 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  46.19 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  46.19 
 
 		 485 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  43.98 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  43.36 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  47.1 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  45.9 
 
 		 492 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  40.5 
 
 		 459 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  40.91 
 
 		 459 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  40.37 
 
 		 469 aa  319  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  39.82 
 
 		 460 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  40.18 
 
 		 459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  39.82 
 
 		 464 aa  302  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  39.77 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  38.73 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  53.51 
 
 		 252 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  30.63 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  26.44 
 
 		 443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  27.42 
 
 		 470 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.4 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  27.55 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  26.92 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  28.43 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  26.62 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  26.23 
 
 		 473 aa  148  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  28.05 
 
 		 328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  26.2 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  26.2 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  23.27 
 
 		 448 aa  143  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  25.9 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  30.06 
 
 		 453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  25.19 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  26.73 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  24.94 
 
 		 452 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  26.65 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  26.56 
 
 		 446 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  25.62 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  25.62 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  25.59 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  26.85 
 
 		 445 aa  133  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  30.06 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  30.06 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  27.27 
 
 		 429 aa  133  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  27.46 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  24.22 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  30.06 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  29.28 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  25.89 
 
 		 489 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  26.6 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.18 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  24.28 
 
 		 455 aa  130  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  25.93 
 
 		 484 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  23.84 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  23.53 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4582  cytochrome P450  24.62 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4670  cytochrome P450  24.62 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4965  cytochrome P450  24.62 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.809651  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  24.81 
 
 		 476 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  29.54 
 
 		 457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43938  predicted protein  25.23 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.270818  normal  0.169117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  25.38 
 
 		 430 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  24.65 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  24.76 
 
 		 457 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  25.88 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  24.42 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  26.8 
 
 		 473 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63421  Cytochrome P450 51 (CYPLI) (P450-LIA1) (Sterol 14-alpha demethylase) (Lanosterol 14-alpha demethylase) (P450-14DM)  23.85 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.195375  normal  0.579386 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  26.69 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  26.69 
 
 		 450 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  24.76 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  25.12 
 
 		 445 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  26.39 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  27.74 
 
 		 1053 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  22.86 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  29.43 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  23.1 
 
 		 457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  25.48 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  24.35 
 
 		 444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  27.83 
 
 		 462 aa  121  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  29.27 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  25.62 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  22.85 
 
 		 457 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  25.42 
 
 		 440 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  24.32 
 
 		 468 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  21.57 
 
 		 459 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  26.2 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  25.45 
 
 		 484 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  26.94 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  24.77 
 
 		 460 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08283  14-alpha sterol demethylase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96W77]  23.34 
 
 		 526 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00402354  normal  0.130811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>