More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2940 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  95.33 
 
 
450 aa  831    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  100 
 
 
450 aa  884    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  100 
 
 
450 aa  884    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  40.55 
 
 
440 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  36.89 
 
 
455 aa  265  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  33.03 
 
 
459 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  36.22 
 
 
453 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  37.35 
 
 
468 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  33.87 
 
 
447 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  35.73 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  33.6 
 
 
447 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  36.96 
 
 
455 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  33.18 
 
 
457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  32.44 
 
 
473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  32.44 
 
 
473 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  32.03 
 
 
467 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  34.58 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  33.09 
 
 
462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  32.52 
 
 
454 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  32.52 
 
 
454 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  31.34 
 
 
457 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  31.1 
 
 
457 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  36.78 
 
 
455 aa  216  7e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  29.71 
 
 
468 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  29.07 
 
 
444 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  35.7 
 
 
467 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  38.4 
 
 
462 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  35.82 
 
 
490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  35.57 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  35.64 
 
 
460 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  37.13 
 
 
481 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  31.57 
 
 
448 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  32.07 
 
 
449 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  32.07 
 
 
449 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  31.57 
 
 
449 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  33.76 
 
 
480 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  36.18 
 
 
453 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  32.13 
 
 
476 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  31.28 
 
 
428 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  34.29 
 
 
440 aa  170  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  30.88 
 
 
448 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  33.74 
 
 
447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  33.74 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  33.74 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  31.8 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.86 
 
 
459 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  33.33 
 
 
451 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  31.68 
 
 
449 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  33.88 
 
 
474 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  30.25 
 
 
455 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  33.95 
 
 
416 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  34.22 
 
 
446 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  34.11 
 
 
489 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  28.71 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  33.42 
 
 
442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  29.46 
 
 
441 aa  153  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  33.51 
 
 
459 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  30.06 
 
 
470 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  30.5 
 
 
430 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  33.92 
 
 
479 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  33.74 
 
 
472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5712  cytochrome P450  30.92 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119413  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.94 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  29.74 
 
 
447 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  31.62 
 
 
445 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  30.71 
 
 
441 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.13 
 
 
446 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  30.7 
 
 
492 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.13 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  25.69 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  31.34 
 
 
461 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  28.89 
 
 
443 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  30.7 
 
 
492 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  29.43 
 
 
454 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  27.32 
 
 
495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  27.32 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  32.55 
 
 
462 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  31.61 
 
 
482 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  32.52 
 
 
466 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  32.83 
 
 
466 aa  139  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  28.86 
 
 
433 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  32.37 
 
 
453 aa  138  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.63 
 
 
445 aa  137  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  31.86 
 
 
484 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  34.58 
 
 
452 aa  136  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  29.59 
 
 
444 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  29.81 
 
 
429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  28.42 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  27.13 
 
 
457 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  31.91 
 
 
467 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  31.88 
 
 
463 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  22.22 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  23.05 
 
 
448 aa  133  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  27.54 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  30.73 
 
 
1380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  32.86 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  30.37 
 
 
1373 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  30.37 
 
 
1373 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  27.86 
 
 
459 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  32.99 
 
 
457 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>