More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1717 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  100 
 
 
474 aa  953    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  100 
 
 
474 aa  953    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  98.68 
 
 
453 aa  900    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  64.57 
 
 
457 aa  593  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  66.74 
 
 
453 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  65.46 
 
 
465 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  46.61 
 
 
452 aa  411  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  37.11 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  36.63 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  30.94 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  33.42 
 
 
448 aa  213  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  37.23 
 
 
458 aa  207  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  29.79 
 
 
441 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  31.82 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  31.37 
 
 
1365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  33.08 
 
 
482 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  36.29 
 
 
463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  30.85 
 
 
454 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  33.25 
 
 
445 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  33.16 
 
 
459 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  32.12 
 
 
439 aa  192  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  30.75 
 
 
444 aa  190  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  31.22 
 
 
1380 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  30.96 
 
 
1373 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.4 
 
 
452 aa  186  7e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.23 
 
 
454 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  30.71 
 
 
1373 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  32.07 
 
 
1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  32.07 
 
 
1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  32.07 
 
 
1373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  32.07 
 
 
1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  32.07 
 
 
1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  32.44 
 
 
469 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  30.93 
 
 
432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  30.6 
 
 
445 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  31.78 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  29.02 
 
 
1053 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  35.26 
 
 
471 aa  179  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  28.42 
 
 
457 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  34.02 
 
 
452 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  37.04 
 
 
463 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.68 
 
 
466 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  30.47 
 
 
480 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  32.68 
 
 
489 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3467  cytochrome P450  32.02 
 
 
1064 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  34.74 
 
 
462 aa  177  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  29.29 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  33.76 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.39 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  34.84 
 
 
470 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.78 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  28.54 
 
 
459 aa  170  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  40 
 
 
473 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  33.24 
 
 
446 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  29.15 
 
 
451 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  27.64 
 
 
461 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  29.95 
 
 
455 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  33.12 
 
 
464 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27.96 
 
 
460 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  27.88 
 
 
495 aa  168  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  35.13 
 
 
464 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  33.91 
 
 
466 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  29.68 
 
 
431 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  33.91 
 
 
466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  33.66 
 
 
467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  33.07 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  30.33 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  30 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  34.3 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  29.49 
 
 
525 aa  163  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  31.84 
 
 
479 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  31.2 
 
 
465 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  26.03 
 
 
448 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  31.05 
 
 
474 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  30.39 
 
 
1055 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  29.04 
 
 
462 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  34.46 
 
 
429 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  34.04 
 
 
460 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  29.05 
 
 
508 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  30.17 
 
 
458 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  28.75 
 
 
467 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  29.34 
 
 
453 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  26.76 
 
 
433 aa  154  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  29.34 
 
 
453 aa  154  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  31.99 
 
 
446 aa  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  31.06 
 
 
1079 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  31.06 
 
 
1079 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  28.57 
 
 
466 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  29.34 
 
 
453 aa  152  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  26.93 
 
 
1065 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  32.23 
 
 
449 aa  152  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  27.88 
 
 
437 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  31.39 
 
 
452 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  33.58 
 
 
457 aa  151  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  31.41 
 
 
470 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.7 
 
 
1065 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.7 
 
 
1065 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  29.02 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.7 
 
 
1065 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  29.2 
 
 
461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>