More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7679 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0853  cytochrome P450  73.3 
 
 
459 aa  694    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4636  cytochrome P450  74.38 
 
 
459 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4693  cytochrome P450  74.72 
 
 
460 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0772  cytochrome P450  73.66 
 
 
459 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  100 
 
 
453 aa  934    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0663  cytochrome P450  58.68 
 
 
469 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.021645  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3337  cytochrome P450  56.59 
 
 
464 aa  508  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3723  cytochrome P450  40.63 
 
 
448 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2664  cytochrome P450  42.19 
 
 
441 aa  333  4e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.100989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5215  cytochrome P450  39.37 
 
 
480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1575  hitchhiker  0.00605855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4847  cytochrome P450  39.37 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4935  cytochrome P450  39.37 
 
 
480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2031  cytochrome P450  38.7 
 
 
493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207493  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4315  cytochrome P450  37.36 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437646  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2503  cytochrome P450  39.77 
 
 
480 aa  301  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.349714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1808  cytochrome P450  36.91 
 
 
497 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.341009  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1855  cytochrome P450  36.91 
 
 
497 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.180197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1527  cytochrome P450  38.6 
 
 
482 aa  295  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3200  cytochrome P450  38.74 
 
 
485 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293272  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3188  cytochrome P450  38.74 
 
 
485 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3250  cytochrome P450  38.74 
 
 
485 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.881715  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3794  cytochrome P450  36.26 
 
 
446 aa  292  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3562  cytochrome P450  39.16 
 
 
451 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13076  cytochrome P450 136 cyp136  37.92 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.867728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  31.63 
 
 
470 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2680  cytochrome P450  31.02 
 
 
443 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4605  cytochrome P450  30.29 
 
 
469 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.472577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4119  cytochrome P450  28.84 
 
 
429 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2966  cytochrome P450  30.89 
 
 
475 aa  188  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.675842  hitchhiker  0.00699967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2772  cytochrome P450  26.26 
 
 
448 aa  180  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.686611  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.82 
 
 
447 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  28.73 
 
 
459 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  29.13 
 
 
479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5041  cytochrome P450  30.72 
 
 
328 aa  166  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  27.7 
 
 
445 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  27 
 
 
551 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  28.57 
 
 
466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  27.29 
 
 
463 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  24.94 
 
 
447 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  27.88 
 
 
452 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3659  cytochrome P450  27.38 
 
 
473 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  26.8 
 
 
454 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  27.39 
 
 
439 aa  140  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  24.51 
 
 
432 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  27.29 
 
 
1365 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4604  cytochrome P450-like protein  39.57 
 
 
252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27.44 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  29.11 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  25.06 
 
 
459 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  26.46 
 
 
1380 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  25.87 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.06 
 
 
1373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  27.54 
 
 
459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  25.06 
 
 
1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  24.83 
 
 
1373 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  25.06 
 
 
1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  25.06 
 
 
1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  25.06 
 
 
1373 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  25.06 
 
 
1373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  29.08 
 
 
453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  29.77 
 
 
457 aa  130  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19470  cytochrome P450  27.92 
 
 
441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0708378  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  27.46 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  28.32 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63421  Cytochrome P450 51 (CYPLI) (P450-LIA1) (Sterol 14-alpha demethylase) (Lanosterol 14-alpha demethylase) (P450-14DM)  25.12 
 
 
526 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.195375  normal  0.579386 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  27.83 
 
 
446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  28.79 
 
 
453 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  24.87 
 
 
458 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  25.7 
 
 
473 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  25.7 
 
 
473 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  28.48 
 
 
474 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  28.48 
 
 
474 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  32.38 
 
 
448 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  29.38 
 
 
445 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3498  cytochrome P450  26.12 
 
 
450 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.340562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  25.36 
 
 
471 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  23.86 
 
 
455 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  27.69 
 
 
457 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  25.36 
 
 
471 aa  124  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  27.67 
 
 
446 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  27.36 
 
 
440 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  25.06 
 
 
444 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  26.65 
 
 
430 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  24.76 
 
 
454 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  25.6 
 
 
463 aa  121  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  30.99 
 
 
452 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  25.94 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1596  cytochrome P450  25 
 
 
452 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  28.3 
 
 
462 aa  119  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  24.34 
 
 
462 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  23 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  28.36 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  25.35 
 
 
452 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  31.58 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  23.61 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_31339  predicted protein  23 
 
 
482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  25.84 
 
 
445 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5161  cytochrome P450  24.44 
 
 
452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  24.66 
 
 
470 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  24.24 
 
 
441 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>