More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1286 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  100 
 
 
448 aa  888    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  43.74 
 
 
452 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  41.88 
 
 
461 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3807  cytochrome P450  43.66 
 
 
460 aa  335  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  35.97 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  30.36 
 
 
459 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  34.24 
 
 
482 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  33.17 
 
 
454 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  27.29 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  34.4 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  30.79 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  33.59 
 
 
452 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  28.2 
 
 
448 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.3 
 
 
1365 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  32.24 
 
 
1373 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  31.53 
 
 
1380 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  32.79 
 
 
452 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  32 
 
 
1373 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.55 
 
 
454 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  31.37 
 
 
1373 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  30.88 
 
 
444 aa  186  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  31.37 
 
 
1373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  31.37 
 
 
1373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  31.37 
 
 
1373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  31.37 
 
 
1373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  31.26 
 
 
447 aa  183  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  34.96 
 
 
463 aa  182  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  30.91 
 
 
466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  29.02 
 
 
459 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  31.51 
 
 
445 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  28.64 
 
 
446 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  29.76 
 
 
469 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  29.61 
 
 
458 aa  172  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.88 
 
 
445 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.28 
 
 
452 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  30.16 
 
 
471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  30.16 
 
 
471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  32.03 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  28.44 
 
 
457 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  32.29 
 
 
445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  28.57 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27 
 
 
441 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  30.43 
 
 
439 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  27.5 
 
 
461 aa  159  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  27.5 
 
 
495 aa  159  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  31.16 
 
 
463 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  31.77 
 
 
473 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  27.62 
 
 
460 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  31.15 
 
 
473 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  30.75 
 
 
462 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  30.27 
 
 
462 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  30.36 
 
 
462 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  32.12 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  30.73 
 
 
462 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  26.96 
 
 
461 aa  146  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  24.69 
 
 
448 aa  146  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  31.62 
 
 
466 aa  145  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  31.3 
 
 
479 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  31.3 
 
 
462 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  26.04 
 
 
453 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.8 
 
 
453 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  30.88 
 
 
467 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  29.66 
 
 
460 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  29.23 
 
 
464 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  29.5 
 
 
431 aa  143  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  25.8 
 
 
453 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  30.52 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  27.02 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  26.95 
 
 
468 aa  141  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  30.88 
 
 
466 aa  141  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.82 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  29.98 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  29.29 
 
 
470 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  29.75 
 
 
430 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0814  cytochrome P450  28.47 
 
 
444 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  28.85 
 
 
446 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  29.74 
 
 
489 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50101  lutein deficient 1-like protein  23.96 
 
 
644 aa  137  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  29.57 
 
 
479 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  31.17 
 
 
453 aa  136  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  32.03 
 
 
452 aa  136  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  31.38 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  29.22 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  31.2 
 
 
459 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29.17 
 
 
474 aa  132  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  27.56 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  26.05 
 
 
470 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  27.41 
 
 
437 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  29.45 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  29.65 
 
 
458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11684  cytochrome P450 139 cyp139  29.65 
 
 
430 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.222958 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  25.39 
 
 
546 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  24.21 
 
 
457 aa  126  9e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1689  cytochrome P450  28.89 
 
 
432 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163805  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  29.18 
 
 
464 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  26.12 
 
 
563 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7679  putative cytochrome P450 family protein  32.38 
 
 
453 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  32.16 
 
 
457 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7149  P-450 monooxygenase  27.6 
 
 
456 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.472347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>