More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1270 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  98.47 
 
 		 459 aa  884    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  91.23 
 
 		 452 aa  737    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  100 
 
 		 459 aa  897    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  59.28 
 
 		 478 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  56.39 
 
 		 462 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  58.81 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  56.52 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  56.31 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  54.87 
 
 		 460 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  44.52 
 
 		 457 aa  326  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  43.79 
 
 		 450 aa  302  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  44.74 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  39.22 
 
 		 480 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  39.23 
 
 		 465 aa  270  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  40.62 
 
 		 462 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  40.61 
 
 		 470 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  38.89 
 
 		 467 aa  253  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  39.04 
 
 		 464 aa  249  9e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  39.47 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  39.25 
 
 		 466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  38.64 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  34.92 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  38.76 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  36.83 
 
 		 466 aa  236  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  35.85 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  34.58 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  33.88 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  34.33 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  38.71 
 
 		 463 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  31.78 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  35.15 
 
 		 470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  34.45 
 
 		 463 aa  213  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  32.31 
 
 		 484 aa  210  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  37.41 
 
 		 473 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.49 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  32.17 
 
 		 452 aa  206  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  37.95 
 
 		 471 aa  206  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  36.24 
 
 		 471 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  36.78 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  33.67 
 
 		 482 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  34.91 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  35.7 
 
 		 466 aa  199  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  35.49 
 
 		 454 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  33.68 
 
 		 441 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  29.2 
 
 		 448 aa  196  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  33.11 
 
 		 458 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  29.8 
 
 		 448 aa  195  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  33.86 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.12 
 
 		 1365 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  31.25 
 
 		 1380 aa  187  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  31.25 
 
 		 1373 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  36.56 
 
 		 453 aa  186  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.82 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  33.41 
 
 		 437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  31.01 
 
 		 1373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 		 1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 		 1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  31.01 
 
 		 1373 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 		 1373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  31.01 
 
 		 1373 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  30.37 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  28.93 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  30.24 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  31.68 
 
 		 460 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  28.03 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  28.5 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  34.57 
 
 		 445 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  35.31 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.03 
 
 		 459 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  27.31 
 
 		 457 aa  177  5e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  32.39 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  32.4 
 
 		 452 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  30.29 
 
 		 459 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  30.63 
 
 		 546 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.64 
 
 		 446 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.79 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  30.25 
 
 		 432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  32.68 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.13 
 
 		 445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  32.62 
 
 		 489 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  31 
 
 		 449 aa  162  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  30.1 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  31.78 
 
 		 453 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  30.51 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  30.66 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  30.84 
 
 		 469 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.46 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.57 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29.69 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  28.19 
 
 		 451 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  34.55 
 
 		 457 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  30.39 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  30 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  28.19 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  31.17 
 
 		 452 aa  148  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  32.04 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  32.38 
 
 		 473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  28.19 
 
 		 495 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  28.72 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  28.45 
 
 		 525 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>