More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3072 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  100 
 
 
437 aa  882    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  38.86 
 
 
482 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  36.73 
 
 
454 aa  246  8e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  36.14 
 
 
454 aa  239  5.999999999999999e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  33.41 
 
 
455 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  37.28 
 
 
453 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  36.3 
 
 
452 aa  233  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  33.7 
 
 
1373 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  33.7 
 
 
1373 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  33.7 
 
 
1373 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  33.7 
 
 
1365 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  33.7 
 
 
1373 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  33.7 
 
 
1373 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  36.28 
 
 
452 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  33.7 
 
 
1373 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  33.7 
 
 
1373 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  33.04 
 
 
1380 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  33.26 
 
 
444 aa  226  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  36.38 
 
 
452 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  37.11 
 
 
462 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.59 
 
 
441 aa  217  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  36.21 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  36.36 
 
 
466 aa  209  9e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  32.85 
 
 
458 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  33.24 
 
 
446 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.42 
 
 
459 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  35.28 
 
 
478 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  31.88 
 
 
457 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  31.33 
 
 
432 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  34.23 
 
 
489 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  35.91 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  31.87 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  34.81 
 
 
461 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  33.77 
 
 
471 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  32 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  31.65 
 
 
433 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  37.05 
 
 
460 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  29.05 
 
 
459 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  36.1 
 
 
473 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  33.42 
 
 
462 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.03 
 
 
471 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.04 
 
 
445 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  33.59 
 
 
462 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  32.24 
 
 
460 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  30.54 
 
 
448 aa  192  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  30.47 
 
 
451 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  35.55 
 
 
470 aa  192  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  31.38 
 
 
468 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  36.27 
 
 
429 aa  188  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  30.07 
 
 
431 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  33.81 
 
 
464 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  33.81 
 
 
459 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  32.98 
 
 
464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  33.57 
 
 
459 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  31.2 
 
 
474 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  35.58 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.16 
 
 
439 aa  183  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  29.12 
 
 
447 aa  182  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  32.85 
 
 
452 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.98 
 
 
447 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  34.42 
 
 
480 aa  182  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  31.1 
 
 
462 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  30.36 
 
 
484 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  32.7 
 
 
470 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  29.09 
 
 
469 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  31.05 
 
 
466 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  31.49 
 
 
467 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.78 
 
 
452 aa  176  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  32.64 
 
 
465 aa  176  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  34.74 
 
 
457 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  34.45 
 
 
463 aa  176  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  30.56 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  31.8 
 
 
463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  30.48 
 
 
466 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  31.98 
 
 
462 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  35.32 
 
 
479 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  30.58 
 
 
452 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  30.95 
 
 
479 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.66 
 
 
445 aa  169  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  29.97 
 
 
461 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  29.82 
 
 
495 aa  169  1e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  27.86 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  32.55 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  27.59 
 
 
466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  30.05 
 
 
1072 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  25.71 
 
 
457 aa  157  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.79 
 
 
453 aa  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3190  cytochrome P450 CYP262A1  30.29 
 
 
461 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.298137  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  28.46 
 
 
492 aa  156  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  28.22 
 
 
461 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  30.65 
 
 
473 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  28.68 
 
 
474 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  28.23 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  28.68 
 
 
474 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  28.68 
 
 
453 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  32.33 
 
 
455 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  25.91 
 
 
453 aa  155  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  29.73 
 
 
1075 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  28.35 
 
 
560 aa  154  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  25.55 
 
 
453 aa  154  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>