More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0051 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  68.83 
 
 		 460 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  76.84 
 
 		 461 aa  702    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  74.89 
 
 		 462 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  100 
 
 		 462 aa  923    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  76.19 
 
 		 462 aa  717    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  59.73 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  58.81 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  57.43 
 
 		 452 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  52.76 
 
 		 478 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  44.77 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  44.27 
 
 		 450 aa  322  9.000000000000001e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  44.77 
 
 		 455 aa  290  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  39.13 
 
 		 480 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  39.25 
 
 		 465 aa  263  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  37 
 
 		 467 aa  259  9e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  37.31 
 
 		 462 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  37.42 
 
 		 470 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  37.22 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  36.77 
 
 		 466 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  36.4 
 
 		 464 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  35.04 
 
 		 464 aa  239  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  35.13 
 
 		 470 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  34.83 
 
 		 466 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  32.39 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  36.36 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  35.15 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  34.31 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  30.33 
 
 		 468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  32.23 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4920  cytochrome P450  31.56 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  35.75 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  32.43 
 
 		 463 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  32.2 
 
 		 454 aa  205  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  34.66 
 
 		 471 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  33.78 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  33.55 
 
 		 470 aa  199  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  34.44 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  36.01 
 
 		 463 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  31.64 
 
 		 448 aa  196  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  31.32 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  31.05 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  30.33 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  34.18 
 
 		 454 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  30.54 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  32.08 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  30.08 
 
 		 453 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  34.28 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  31.44 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  32.3 
 
 		 1365 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  32.96 
 
 		 449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  33.33 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  34.85 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  30.72 
 
 		 482 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  29.62 
 
 		 1380 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  29.62 
 
 		 1373 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  28.5 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  30.69 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  34.1 
 
 		 452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  29.62 
 
 		 1373 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  29.62 
 
 		 1373 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  29.62 
 
 		 1373 aa  180  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  29.4 
 
 		 1373 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  29.62 
 
 		 1373 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  29.62 
 
 		 1373 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  28.48 
 
 		 447 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  29.66 
 
 		 446 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  33.33 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  31.78 
 
 		 453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  32.01 
 
 		 459 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  34.46 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  31.82 
 
 		 445 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  28.61 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  29.32 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  33.72 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  31.77 
 
 		 460 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  30.48 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  29.75 
 
 		 473 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  32.1 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  32.83 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  30.07 
 
 		 444 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  29.1 
 
 		 447 aa  161  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  36.02 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3258  cytochrome P450  29.31 
 
 		 452 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal  0.462712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.14 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  29.38 
 
 		 455 aa  159  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  30.7 
 
 		 439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  31.5 
 
 		 431 aa  156  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  29.71 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  30.3 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  29.05 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  31.14 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  30.61 
 
 		 452 aa  153  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  32.56 
 
 		 1055 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0858  cytochrome P450  31.42 
 
 		 457 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495713 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  28.87 
 
 		 430 aa  150  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1286  cytochrome P450  30.36 
 
 		 448 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.316909  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3643  cytochrome P450  27.78 
 
 		 444 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.347687  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  29.57 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  30.07 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  27.65 
 
 		 454 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>