More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3754 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  100 
 
 
429 aa  816    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  36.51 
 
 
454 aa  243  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  36.28 
 
 
482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1952  cytochrome P450  38.92 
 
 
1365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112596 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  36.89 
 
 
439 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  31.98 
 
 
448 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  31.51 
 
 
446 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  35.98 
 
 
1373 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  35.98 
 
 
1373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  35.98 
 
 
1373 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  35.98 
 
 
1373 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  35.98 
 
 
1373 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  35.98 
 
 
1373 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  35.75 
 
 
1380 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  35.75 
 
 
1373 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  34.11 
 
 
466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  37.38 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  34.27 
 
 
444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  29.4 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  33.41 
 
 
484 aa  220  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2694  cytochrome P450  35.87 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139584  normal  0.189706 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  38.27 
 
 
462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  35.36 
 
 
452 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  32.62 
 
 
460 aa  212  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  32.09 
 
 
441 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  34.71 
 
 
455 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  36.32 
 
 
489 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  33.5 
 
 
459 aa  203  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  35.41 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  36.41 
 
 
462 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  37.44 
 
 
457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  35.47 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  36.39 
 
 
461 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  32.59 
 
 
431 aa  196  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  36.34 
 
 
467 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  32.5 
 
 
432 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  36.17 
 
 
466 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  37.41 
 
 
471 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  37.41 
 
 
471 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  35.82 
 
 
464 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  30.59 
 
 
433 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  33.33 
 
 
464 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  36.17 
 
 
466 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  36.74 
 
 
470 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  33.59 
 
 
462 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_1824  predicted protein  30.05 
 
 
461 aa  190  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0946641  hitchhiker  0.0013207 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_47300  predicted protein  30.05 
 
 
495 aa  189  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.227145  normal  0.672503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2891  cytochrome P450  31.62 
 
 
457 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00974198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  32.84 
 
 
462 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  32.05 
 
 
447 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  34.3 
 
 
445 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  34.87 
 
 
463 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  38.07 
 
 
478 aa  187  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1926  cytochrome P450  33.65 
 
 
465 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  35.79 
 
 
460 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  28.31 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  30.64 
 
 
458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  31.1 
 
 
546 aa  182  8.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  33.33 
 
 
474 aa  182  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  30.91 
 
 
454 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0833  cytochrome P450  33.74 
 
 
480 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.116769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0051  cytochrome P450  34.46 
 
 
462 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1432  cytochrome P450  35.06 
 
 
459 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0731  cytochrome P450  34.98 
 
 
453 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1270  cytochrome P450  35.06 
 
 
459 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152787  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  36.09 
 
 
450 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  36.27 
 
 
437 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  33.07 
 
 
470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  35.22 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  29.91 
 
 
451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  34.31 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  35.07 
 
 
463 aa  173  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  28.22 
 
 
457 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  29.24 
 
 
466 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  29.3 
 
 
445 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  35.34 
 
 
452 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  29.76 
 
 
470 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  27.97 
 
 
563 aa  170  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4522  cytochrome P450  36.13 
 
 
455 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0554  cytochrome P450  31.03 
 
 
508 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  30.85 
 
 
459 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  31.55 
 
 
452 aa  167  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  33.24 
 
 
445 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  36.74 
 
 
473 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1717  cytochrome P450  34.46 
 
 
474 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.299911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1763  cytochrome P450  34.46 
 
 
474 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649462  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  29.84 
 
 
1053 aa  166  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0245  cytochrome P450  33.5 
 
 
465 aa  166  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.252682 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  27.56 
 
 
453 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  27.07 
 
 
453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  31.72 
 
 
466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1695  cytochrome P450  34.2 
 
 
453 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372847  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3012  cytochrome P450  28.09 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.278209  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  29.61 
 
 
769 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  31.68 
 
 
479 aa  163  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  31.65 
 
 
446 aa  162  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  33.89 
 
 
479 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  28.6 
 
 
469 aa  161  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  27.32 
 
 
453 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  32.22 
 
 
395 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>